107322 / 2012-04-05 - Inny: Instytut Badawczy / Instytut Ogrodnictwa (Skierniewice)

Pojemnik Zużytego Toneru S050194 marki Epson

Cena: 141.45 PLN

Sukcesywne usługi sekwencjonowania DNA oraz syntezy oligonukleotydów do realizacji projektu pt. Polskie szczepy Trichoderma w ochronie roślin i zagospodarowaniu odpadów organicznych nr umowy
UDA-POIG.01.03.01-00-129/09-04, z dnia 15.09.2009 r.

Opis zamówienia

Przedmiotem zamówienia jest sukcesywne świadczenie usług sekwencjonowania DNA oraz syntezy oligonukleotydów w następujący sposób:

SEKWENCJONOWANIE METODĄ SANGERA:
Zamówienie podlega na sekwencjonowaniu DNA mikrooganizmów z zastosowaniem sekwenatorów firmy Applied Biosystems na płytkach 96 dołkowych oraz w probówkach przygotowanych przez Zamawiającego. Standardowa długość odczytów 500-800 nukleotydów (z możliwością odczytów extra long o długości 1000-1100 nukleotydów na kapilarach 80 cm w zależności od jakości matrycy). Matryce wraz ze starterami będą wysyłane pocztą kurierską na koszt Wykonawcy (min. ilość próbek w jednej przesyłce - 10 szt.). Opis próbek do sekwencjonowania (płytki i probówki) za pośrednictwem skrytpu znajdującego się na stronie internetowej Wykonawcy. Wyniki reakcji sekwencjonowania i rozdziału elektroforetycznego będą umieszczone przez Wykonawcę na jego stronie internetowej w formie pliku tekstowego i fluorogramu w formacie .abi otwieranego przez program FinchTV i Chromas. Zamawiający będzie posiadał na stronie swoje indywidualne konto z hasłem znanym tylko Zamawiającemu i Wykonawcy.
Czas wykonania zlecenia do 2 dni roboczych od daty i godziny przekazania próbek (matryca i startery) do sekwencjonowania przez Zamawiającego kurierowi wyznaczonemu przez Wykonawcę, a zamówionemu przez Zamawiającego.
Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca będzie potwierdzał mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 2 dni robocze.
Zamawiający zastrzega sobie prawo do zmniejszenia (lub zwiększenia) ilości jednej usługi na konto innej bez przekraczania zaoferowanej przez Wykonawcę całkowitej wartości zamówienia.

SYNTEZA OLIGONUKLEOTYDÓW:
Przedmiotem zamówienia jest synteza oligonukleotydów standardowych w skalach 20, 40 i 200 nmol.
Poszczególne oligonukleotydy o konkretnej sekwencji będą zamawiane sukcesywnie przez skrypt na polskojęzycznej stronie internetowej Wykonawcy.
Oligonukleotydy będą mieścić się w długości między 15 a 80 nukleotydów.
Czas dostawy max. 72 h (dni robocze) liczony od momentu złożenia zamówienia przez skrypt internetowy w godz. 8:00 - 18:00 (oligonukleotydy zamówienie po 18:00 będą miały naliczany czas realizacji zamówienia od 8:00 dnia następnego).
Koszty za przesyłki kurierskie będzie ponosił Wykonawca. Dostawa oligonukleotydów standardowo w formie zliofilizowanej z informacją w jakiej objętości należy zawiesić otrzymany liofilizat, aby uzyskać stężenie 100 µM. Dla wybranych zamówień musi istnieć możliwość otrzymywania oligonukleotydów zawieszonych w wodzie (prośba będzie zaznaczana w polu uwagi podczas składania danego zamówienia).
Na stronie Wykonawcy Zamawiający będzie posiadał spersonalizowane konto opatrzone hasłem, za którego pośrednictwem będzie składał zamówienia oraz będzie miał możliwości śledzenia historii wszystkich zamówień i faktur.

SEKWENCJONOWANIE GENOMOWE NGS:
Sekwencjonowanie z przygotowaniem biblioteki losowych fragmentów DNA:
Usługa obejmuje wykonanie sekwencjonowania całkowitego DNA wyizolowanego z próbki gleby na sekwenatorze GS Junior w technologii 454 Titanium. Zamawiający dostarczy Wykonawcy DNA oczyszczone standardowymi metodami biologii molekularnej w ilości nie mniejszej niż 1500 ng w jednej próbce. Sumaryczna ilość odczytanych zasad z jednego sekwencjonowania to 35 - 55 mln nukleotydów w około 100 tys. odczytów zestawionych w kontigi. Średnia długość pojedynczego odczytu to 400 zasad. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane Zleceniodawcy w ciągu maksymalnie 7 dni roboczych od momentu dostarczenia DNA w wymaganej ilości do siedziby Wykonawcy.
Sekwencjonowanie z przygotowaniem barkodowanej biblioteki amplifikowanych fragmentów DNA:
Usługa obejmuje barkodowanie (znakowanie za pomocą swoistych sekwencji adaptorowych) produktu PCR lub stechiometrycznych mieszanin produktów PCR oraz ich sekwencjonowanie na sekwenatorze GS Junior w technologii 454 Titanium. Zamawiający dostarczy Wykonawcy niezmieszane fragmenty DNA (produkty PCR) oczyszczone z żelu, standardowymi metodami biologii molekularnej, w ilości nie mniejszej niż 100 ng każdy. Sumaryczna ilość odczytanych zasad z jednego sekwencjonowania to 35 - 55 mln nukleotydów w 70 tys. odczytów zestawionych w kontigi. Średnia długość pojedynczego odczytu to 400 zasad. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane Zleceniodawcy w ciągu maksymalnie 7 dni roboczych od momentu dostarczenia DNA w wymaganej ilości do siedziby Wykonawcy .
Szczegółowy zakres praw i obowiązków związanych z realizacją zamówienia określa wzór umowy stanowiący załącznik do SIWZ.

Numer biuletynu: 1

Pozycja w biuletynie: 107322

Data publikacji: 2012-04-05

Nazwa: Instytut Ogrodnictwa

Ulica: ul. Konstytucji 3 Maja 1/3

Numer domu: 1/3

Miejscowość: Skierniewice

Kod pocztowy: 96-100

Województwo / kraj: łódzkie

Numer telefonu: 46 833 20 21

Numer faxu: 46 833 32 28

Adres strony internetowej: www.inhort.pl

Regon: 10102334200000

Typ ogłoszenia: ZP-400

Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak

Ogłoszenie dotyczy: 1

Rodzaj zamawiającego: Inny: Instytut Badawczy

Inny rodzaj zamawiającego: Instytut Badawczy

Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
Sukcesywne usługi sekwencjonowania DNA oraz syntezy oligonukleotydów do realizacji projektu pt. Polskie szczepy Trichoderma w ochronie roślin i zagospodarowaniu odpadów organicznych nr umowy
UDA-POIG.01.03.01-00-129/09-04, z dnia 15.09.2009 r.

Rodzaj zamówienia: D

Przedmiot zamówienia:
Przedmiotem zamówienia jest sukcesywne świadczenie usług sekwencjonowania DNA oraz syntezy oligonukleotydów w następujący sposób:

SEKWENCJONOWANIE METODĄ SANGERA:
Zamówienie podlega na sekwencjonowaniu DNA mikrooganizmów z zastosowaniem sekwenatorów firmy Applied Biosystems na płytkach 96 dołkowych oraz w probówkach przygotowanych przez Zamawiającego. Standardowa długość odczytów 500-800 nukleotydów (z możliwością odczytów extra long o długości 1000-1100 nukleotydów na kapilarach 80 cm w zależności od jakości matrycy). Matryce wraz ze starterami będą wysyłane pocztą kurierską na koszt Wykonawcy (min. ilość próbek w jednej przesyłce - 10 szt.). Opis próbek do sekwencjonowania (płytki i probówki) za pośrednictwem skrytpu znajdującego się na stronie internetowej Wykonawcy. Wyniki reakcji sekwencjonowania i rozdziału elektroforetycznego będą umieszczone przez Wykonawcę na jego stronie internetowej w formie pliku tekstowego i fluorogramu w formacie .abi otwieranego przez program FinchTV i Chromas. Zamawiający będzie posiadał na stronie swoje indywidualne konto z hasłem znanym tylko Zamawiającemu i Wykonawcy.
Czas wykonania zlecenia do 2 dni roboczych od daty i godziny przekazania próbek (matryca i startery) do sekwencjonowania przez Zamawiającego kurierowi wyznaczonemu przez Wykonawcę, a zamówionemu przez Zamawiającego.
Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca będzie potwierdzał mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 2 dni robocze.
Zamawiający zastrzega sobie prawo do zmniejszenia (lub zwiększenia) ilości jednej usługi na konto innej bez przekraczania zaoferowanej przez Wykonawcę całkowitej wartości zamówienia.

SYNTEZA OLIGONUKLEOTYDÓW:
Przedmiotem zamówienia jest synteza oligonukleotydów standardowych w skalach 20, 40 i 200 nmol.
Poszczególne oligonukleotydy o konkretnej sekwencji będą zamawiane sukcesywnie przez skrypt na polskojęzycznej stronie internetowej Wykonawcy.
Oligonukleotydy będą mieścić się w długości między 15 a 80 nukleotydów.
Czas dostawy max. 72 h (dni robocze) liczony od momentu złożenia zamówienia przez skrypt internetowy w godz. 8:00 - 18:00 (oligonukleotydy zamówienie po 18:00 będą miały naliczany czas realizacji zamówienia od 8:00 dnia następnego).
Koszty za przesyłki kurierskie będzie ponosił Wykonawca. Dostawa oligonukleotydów standardowo w formie zliofilizowanej z informacją w jakiej objętości należy zawiesić otrzymany liofilizat, aby uzyskać stężenie 100 µM. Dla wybranych zamówień musi istnieć możliwość otrzymywania oligonukleotydów zawieszonych w wodzie (prośba będzie zaznaczana w polu uwagi podczas składania danego zamówienia).
Na stronie Wykonawcy Zamawiający będzie posiadał spersonalizowane konto opatrzone hasłem, za którego pośrednictwem będzie składał zamówienia oraz będzie miał możliwości śledzenia historii wszystkich zamówień i faktur.

SEKWENCJONOWANIE GENOMOWE NGS:
Sekwencjonowanie z przygotowaniem biblioteki losowych fragmentów DNA:
Usługa obejmuje wykonanie sekwencjonowania całkowitego DNA wyizolowanego z próbki gleby na sekwenatorze GS Junior w technologii 454 Titanium. Zamawiający dostarczy Wykonawcy DNA oczyszczone standardowymi metodami biologii molekularnej w ilości nie mniejszej niż 1500 ng w jednej próbce. Sumaryczna ilość odczytanych zasad z jednego sekwencjonowania to 35 - 55 mln nukleotydów w około 100 tys. odczytów zestawionych w kontigi. Średnia długość pojedynczego odczytu to 400 zasad. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane Zleceniodawcy w ciągu maksymalnie 7 dni roboczych od momentu dostarczenia DNA w wymaganej ilości do siedziby Wykonawcy.
Sekwencjonowanie z przygotowaniem barkodowanej biblioteki amplifikowanych fragmentów DNA:
Usługa obejmuje barkodowanie (znakowanie za pomocą swoistych sekwencji adaptorowych) produktu PCR lub stechiometrycznych mieszanin produktów PCR oraz ich sekwencjonowanie na sekwenatorze GS Junior w technologii 454 Titanium. Zamawiający dostarczy Wykonawcy niezmieszane fragmenty DNA (produkty PCR) oczyszczone z żelu, standardowymi metodami biologii molekularnej, w ilości nie mniejszej niż 100 ng każdy. Sumaryczna ilość odczytanych zasad z jednego sekwencjonowania to 35 - 55 mln nukleotydów w 70 tys. odczytów zestawionych w kontigi. Średnia długość pojedynczego odczytu to 400 zasad. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane Zleceniodawcy w ciągu maksymalnie 7 dni roboczych od momentu dostarczenia DNA w wymaganej ilości do siedziby Wykonawcy .
Szczegółowy zakres praw i obowiązków związanych z realizacją zamówienia określa wzór umowy stanowiący załącznik do SIWZ.

Kody CPV:
731110003 (Laboratoryjne usługi badawcze)

Czy zamówienie jest podzielone na części: Nie

Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej: Nie

Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających: Nie

Czas: D

Data zakończenia: 31/12/2012

Informacja na temat wadium: Zamawiający nie wymaga wadium.

Zaliczka: Nie

Uprawnienia:
Ocena spełnienia warunków wymaganych od Wykonawców zostanie dokonana wg formuły spełnia - nie spełnia wyłącznie w oparciu o oświadczenia i dokumenty załączone do oferty

Wiedza i doświadczenie:
Warunek ten zostanie spełniony, jeśli Wykonawca wykaże, że w okresie ostatnich trzech lat przed upływem terminu składania ofert, a jeżeli okres prowadzenia działalności jest krótszy - w tym okresie, wykonał lub wykonuje minimum dwie usługi sekwencjonowania w zakresie niezbędnym do wykazania spełniania warunku wiedzy i doświadczenia, z podaniem ich wartości, przedmiotu, dat wykonania i odbiorców oraz załączy dokumenty potwierdzające, że te usługi zostały wykonane lub są wykonywane należycie

Potencjał techniczny:
Ocena spełnienia warunków wymaganych od Wykonawców zostanie dokonana wg formuły spełnia - nie spełnia wyłącznie w oparciu o oświadczenia i dokumenty załączone do oferty

Osoby zdolne do zrealizowania zamówienia:
Ocena spełnienia warunków wymaganych od Wykonawców zostanie dokonana wg formuły spełnia - nie spełnia wyłącznie w oparciu o oświadczenia i dokumenty załączone do oferty

Sytuacja ekonomiczna:
Ocena spełnienia warunków wymaganych od Wykonawców zostanie dokonana wg formuły spełnia - nie spełnia wyłącznie w oparciu o oświadczenia i dokumenty załączone do oferty

Oświadczenie nr 3: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 1: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 2: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 7: Tak

Dokumenty podmiotów zagranicznych: Tak

Dokumenty podmiotów zagranicznych: Tak

inne_dokumenty:
1. Oryginał lub kopię pełnomocnictwa. 1.1. dla osoby/osób podpisującej/cych ofertę do podejmowania zobowiązań w imieniu Wykonawcy składającego ofertę, gdy prawo do podpisania oferty nie wynika z innych dokumentów do niej załączonych (np. aktualne zaświadczenie o wpisie do ewidencji działalności gospodarczej, odpis z właściwego rejestru). 1.2. dla ustanowionego pełnomocnika, do reprezentowania w postępowaniu albo do reprezentowania w postępowaniu i zawarcia umowy - dotyczy wykonawców wspólnie ubiegających się o udzielenie zamówienia. Zgodnie z art. 23 ust. 2 ustawy wykonawcy ubiegający się wspólnie o udzielenie zamówienia zobowiązani są do ustanowienia pełnomocnika do reprezentowania ich w postępowaniu o udzielenie niniejszego zamówienia albo reprezentowania w postępowaniu i zawarcia umowy. Wymagana jest forma, rodzaj i zakres pełnomocnictwa właściwy do poszczególnych czynności. W przypadku złożenia kopii pełnomocnictwa, musi być ona potwierdzona za zgodność z oryginałem notarialnie. Zgodnie z art. 23 ust. 2 ustawy wykonawcy ubiegający się wspólnie o udzielenie zamówienia zobowiązani są do ustanowienia pełnomocnika do reprezentowania ich w postępowaniu o udzielenie niniejszego zamówienia albo reprezentowania w postępowaniu i zawarcia umowy. Wymagana jest forma, rodzaj i zakres pełnomocnictwa właściwy do poszczególnych czynności. W przypadku złożenia kopii pełnomocnictwa, musi być ona potwierdzona za zgodność z oryginałem notarialnie. 2. Wykonawca powołujący się przy wykazywaniu spełniania warunków udziału w postępowaniu, na potencjał innych podmiotów załączy pisemne zobowiązanie tych podmiotów do oddania mu do dyspozycji niezbędnych zasobów na okres korzystania z nich przy wykonywaniu zamówienia. 3. Wykonawcy wspólnie ubiegający się o udzielenie zamówienia: - Wykonawcy ci ustanawiają pełnomocnika do reprezentowania ich w postępowaniu albo do reprezentowania ich w postępowaniu i zawarcia umowy w sprawie zamówienia publicznego, - Wykonawcy ci składają jeden wniosek, przy czym: - dokumenty wymienione w pkt III.4.2 potwierdzające, że Wykonawca nie podlega wykluczeniu składa każdy z Wykonawców oddzielnie, - pozostałe dokumenty składa co najmniej jeden z tych Wykonawców albo wszyscy ci Wykonawcy wspólnie.

III.7 osoby niepełnosprawne: Nie

Kod trybu postepowania: PN

Czy zmiana umowy: Tak

Zmiana umowy:
Zakazuje się zmian istotnych postanowień zawartej umowy w stosunku do treści oferty, na podstawie której dokonano wyboru Wykonawcy z wyłączeniem:
1) możliwości zmiany wysokości wynagrodzenia w przypadku promocyjnego obniżenia cen jednostkowych przez Wykonawcę,
2) możliwości zmiany wysokości wynagrodzenia w przypadku zmiany urzędowej stawki podatku VAT, przy czym zmianie ulegnie wyłącznie cena brutto, cena netto pozostanie bez zmian,
3) możliwości zmiany ilości zamawianego asortymentu przy zachowaniu cen jednostkowych do wysokości maksymalnej wartości przedmiotu umowy zastrzeżonej w § 3 ust. 4 niniejszej umowy,
4) możliwości zmiany terminu usługi w przypadku wystąpienia zdarzeń losowych, niezależnych od Stron. Pod pojęciem zdarzeń losowych Strony rozumieją okoliczności, które pomimo zachowania należytej staranności są nieprzewidywalne oraz którym nie można zapobiec lub przeciwstawić się skutecznie np. klęska żywiołowa, strajk lub inne. Terminy określone w § 2 ust. 1 umowy mogą ulec przedłużeniu o okres trwania przeszkody uniemożliwiającej realizację umowy,
5) możliwości zmiany danych adresowych i podmiotowych Zamawiającego
i Wykonawcy.
Zmiany i uzupełnienia niniejszej umowy wymagają zachowania formy pisemnej pod rygorem nieważności.

Kod kryterium cenowe: A

Czy wykorzystywana będzie aukcja: Nie

Adres strony internetowej specyfikacji i warunków zamówienia: www.inhort.pl

Adres uzyskania specyfikacji i warunków zamówienia:
Instytut Ogrodnictwa, Oddział Sadownictwa, Dział Zamówień Publicznych, 96-100 Skierniewice, ul. Pomologiczna 18 pok.27

Data składania wniosków, ofert: 17/04/2012

Godzina składania wniosków, ofert: 11:00

Miejsce składania:
Instytut Ogrodnictwa, Oddział Sadownictwa, Dział Zamówień Publicznych, 96-100 Skierniewice, ul. Pomologiczna 18 pok. 26

On: O

Termin związania ofertą, liczba dni: 30

Informacje dodatkowe:
Zamówienie finansowane jest ze środków projektu pt. Polskie szczepy Trichoderma w ochronie roślin i zagospodarowaniu odpadów organicznych, nr umowy UDA-POIG.01.03.01-00-129/09-04, z dnia 15.09.2009 r. Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Działania 1.3 Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka 2007 - 2013, Poddziałanie 1.3.1.

Czy unieważnienie postępowania: Nie

Podobne przetargi