139600 / 2012-04-30 - Inny: Instytut Badawczy / Instytut Ogrodnictwa (Skierniewice)

Zgodny z tonerem 9967000877 Czarny marki FullPrint

Cena: 244.77 PLN

Ogłoszenie zawiera informacje aktualizacyjne dotyczące publikacji w biuletynie 1 z dnia 2012-04-05 pod pozycją 107322. Zobacz ogłoszenie 107322 / 2012-04-05 - Inny: Instytut Badawczy.

Numer biuletynu: 1

Pozycja w biuletynie: 139600

Data publikacji: 2012-04-30

Nazwa: Instytut Ogrodnictwa

Ulica: ul. Konstytucji 3 Maja 1/3

Numer domu: 1/3

Miejscowość: Skierniewice

Kod pocztowy: 96-100

Województwo / kraj: łódzkie

Numer telefonu: 46 833 20 21

Numer faxu: 46 833 32 28

Regon: 10102334200000

Typ ogłoszenia: ZP-403

Numer biuletynu: 1

Numer pozycji: 107322

Data wydania biuletynu: 2012-04-05

Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak

Czy zamówienie było ogłoszone w BZP: Tak

Rok ogłoszenia: 2012

Pozycja ogłoszenia: 107322

Czy w BZP zostało zamieszczone ogłoszenie o zmianie: Nie

Ogłoszenie dotyczy: 1

Rodzaj zamawiającego: Inny: Instytut Badawczy

Inny rodzaj zamawiającego: Instytut Badawczy

Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
Sukcesywne usługi sekwencjonowania DNA oraz syntezy oligonukleotydów do realizacji projektu pt. Polskie szczepy Trichoderma w ochronie roślin i zagospodarowaniu odpadów organicznych nr umowy UDA-POIG.01.03.01-00-129/09-04, z dnia 15.09.2009 r

Rodzaj zamówienia: U

Przedmiot zamówienia:
Przedmiotem zamówienia jest sukcesywne świadczenie usług sekwencjonowania DNA oraz syntezy oligonukleotydów w następujący sposób: SEKWENCJONOWANIE METODĄ SANGERA: Zamówienie podlega na sekwencjonowaniu DNA mikrooganizmów z zastosowaniem sekwenatorów firmy Applied Biosystems na płytkach 96 dołkowych oraz w probówkach przygotowanych przez Zamawiającego. Standardowa długość odczytów 500-800 nukleotydów (z możliwością odczytów extra long o długości 1000-1100 nukleotydów na kapilarach 80 cm w zależności od jakości matrycy). Matryce wraz ze starterami będą wysyłane pocztą kurierską na koszt Wykonawcy (min. ilość próbek w jednej przesyłce - 10 szt.). Opis próbek do sekwencjonowania (płytki i probówki) za pośrednictwem skrytpu znajdującego się na stronie internetowej Wykonawcy. Wyniki reakcji sekwencjonowania i rozdziału elektroforetycznego będą umieszczone przez Wykonawcę na jego stronie internetowej w formie pliku tekstowego i fluorogramu w formacie .abi otwieranego przez program FinchTV i Chromas. Zamawiający będzie posiadał na stronie swoje indywidualne konto z hasłem znanym tylko Zamawiającemu i Wykonawcy. Czas wykonania zlecenia do 2 dni roboczych od daty i godziny przekazania próbek (matryca i startery) do sekwencjonowania przez Zamawiającego kurierowi wyznaczonemu przez Wykonawcę, a zamówionemu przez Zamawiającego. Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca będzie potwierdzał mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 2 dni robocze. Zamawiający zastrzega sobie prawo do zmniejszenia (lub zwiększenia) ilości jednej usługi na konto innej bez przekraczania zaoferowanej przez Wykonawcę całkowitej wartości zamówienia. SYNTEZA OLIGONUKLEOTYDÓW: Przedmiotem zamówienia jest synteza oligonukleotydów standardowych w skalach 20, 40 i 200 nmol. Poszczególne oligonukleotydy o konkretnej sekwencji będą zamawiane sukcesywnie przez skrypt na polskojęzycznej stronie internetowej Wykonawcy. Oligonukleotydy będą mieścić się w długości między 15 a 80 nukleotydów. Czas dostawy max. 72 h (dni robocze) liczony od momentu złożenia zamówienia przez skrypt internetowy w godz. 8:00 - 18:00 (oligonukleotydy zamówienie po 18:00 będą miały naliczany czas realizacji zamówienia od 8:00 dnia następnego). Koszty za przesyłki kurierskie będzie ponosił Wykonawca. Dostawa oligonukleotydów standardowo w formie zliofilizowanej z informacją w jakiej objętości należy zawiesić otrzymany liofilizat, aby uzyskać stężenie 100 µM. Dla wybranych zamówień musi istnieć możliwość otrzymywania oligonukleotydów zawieszonych w wodzie (prośba będzie zaznaczana w polu uwagi podczas składania danego zamówienia). Na stronie Wykonawcy Zamawiający będzie posiadał spersonalizowane konto opatrzone hasłem, za którego pośrednictwem będzie składał zamówienia oraz będzie miał możliwości śledzenia historii wszystkich zamówień i faktur. SEKWENCJONOWANIE GENOMOWE NGS: Sekwencjonowanie z przygotowaniem biblioteki losowych fragmentów DNA: Usługa obejmuje wykonanie sekwencjonowania całkowitego DNA wyizolowanego z próbki gleby na sekwenatorze GS Junior w technologii 454 Titanium. Zamawiający dostarczy Wykonawcy DNA oczyszczone standardowymi metodami biologii molekularnej w ilości nie mniejszej niż 1500 ng w jednej próbce. Sumaryczna ilość odczytanych zasad z jednego sekwencjonowania to 35 - 55 mln nukleotydów w około 100 tys. odczytów zestawionych w kontigi. Średnia długość pojedynczego odczytu to 400 zasad. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane Zleceniodawcy w ciągu maksymalnie 7 dni roboczych od momentu dostarczenia DNA w wymaganej ilości do siedziby Wykonawcy. Sekwencjonowanie z przygotowaniem barkodowanej biblioteki amplifikowanych fragmentów DNA: Usługa obejmuje barkodowanie (znakowanie za pomocą swoistych sekwencji adaptorowych) produktu PCR lub stechiometrycznych mieszanin produktów PCR oraz ich sekwencjonowanie na sekwenatorze GS Junior w technologii 454 Titanium. Zamawiający dostarczy Wykonawcy niezmieszane fragmenty DNA (produkty PCR) oczyszczone z żelu, standardowymi metodami biologii molekularnej, w ilości nie mniejszej niż 100 ng każdy. Sumaryczna ilość odczytanych zasad z jednego sekwencjonowania to 35 - 55 mln nukleotydów w 70 tys. odczytów zestawionych w kontigi. Średnia długość pojedynczego odczytu to 400 zasad. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane Zleceniodawcy w ciągu maksymalnie 7 dni roboczych od momentu dostarczenia DNA w wymaganej ilości do siedziby Wykonawcy . Szczegółowy zakres praw i obowiązków związanych z realizacją zamówienia określa wzór umowy stanowiący załącznik do SIWZ

Kod trybu postepowania: PN

Czy zamówienie dotyczy programu UE: Tak

nazwa programu UE:
Zamówienie finansowane jest ze środków projektu pt. Polskie szczepy Trichoderma w ochronie roślin i zagospodarowaniu odpadów organicznych, nr umowy UDA-POIG.01.03.01-00-129/09-04, z dnia 15.09.2009 r. Projekt współfinansowany przez Unię Europejską z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Działania 1.3 Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka 2007 - 2013, Poddziałanie 1.3.1

Nazwa wykonawcy: GENOMED S. A.

Adres pocztowy wykonawcy: ul. Ponczowa 12

Miejscowość: Warszawa

Kod pocztowy: 02-971

ID województwa: 6

Województwo / kraj: mazowieckie

Nazwa:
Sukcesywne usługi sekwencjonowania DNA oraz syntezy oligonukleotydów do realizacji projektu pt. Polskie szczepy Trichoderma w ochronie roślin i zagospodarowaniu odpadów organicznych nr umowy UDA-POIG.01.03.01-00-129/09-04, z dnia 15.09.2009 r

Nr częsci: 1

Data udzielenie zamówienia: 24/04/2012

Liczba ofert: 1

Liczba odrzuconych ofert: 0

Szacunkowa wartość zamówienia: 40096,00

Cena wybranej oferty: 49313,16

Cena minimalna: 49313,16

Cena maksymalna: 49313,16

Kod waluty: 1

Waluta (PLN): PLN

Kody CPV:
731110003 (Laboratoryjne usługi badawcze)

Podobne przetargi