Informacje o przetargach publicznych.
Site Search

92629 / 2012-04-24 - Uczelnia publiczna / Gdański Uniwersytet Medyczny (Gdańsk)

Ogłoszenie zawiera informacje aktualizacyjne dotyczące publikacji w biuletynie 1 z dnia 2012-02-03 pod pozycją 29357. Zobacz ogłoszenie 29357 / 2012-02-03 - Uczelnia publiczna.

Numer biuletynu: 1

Pozycja w biuletynie: 92629

Data publikacji: 2012-04-24

Nazwa: Gdański Uniwersytet Medyczny

Ulica: ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a

Numer domu: 3a

Miejscowość: Gdańsk

Kod pocztowy: 80-210

Województwo / kraj: pomorskie

Numer telefonu: (058) 349 12 23

Numer faxu: (058) 349 12 24

Adres strony internetowej: www.gumed.edu.pl

Regon: 00028862700000

Typ ogłoszenia: ZP-403

Numer biuletynu: 1

Numer pozycji: 29357

Data wydania biuletynu: 2012-02-03

Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak

Czy zamówienie było ogłoszone w BZP: Tak

Rok ogłoszenia: 2012

Pozycja ogłoszenia: 29357

Czy w BZP zostało zamieszczone ogłoszenie o zmianie: Tak

Ogłoszenie dotyczy: 1

Rodzaj zamawiającego: Uczelnia publiczna

Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu

Rodzaj zamówienia: U

Przedmiot zamówienia:
1. Przedmiotem zamówienia jest usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013; 2. Wykonawca zapewni: A) wykonanie usługi metodą głębokiego sekwencjonowania (ang. next generation sequencing) DNA dla egzomu - dostarczonego przez zamawiającego materiału: 144 próbek DNA wyizolowanych z ludzkich kożuszków leukocytarnych standardowym zestawem firmy Qiagen (QIAamp DNA Blood Mini kit, nr kat 51104), w tym: egzonów genów kodujących białka, regionów nie ulegających translacji (sekwencje 3 i 5 UTR), niekodujących krótkich RNA, (w tym sekwencji kodujących, wymienionych w załączniku nr 4 do SIWZ - lista mikroRNA. B) Wśród analizowanych próbek będą 2 powtórzone próbki (tj. po 2 próbki od 2 pacjentów). C) Wykonawca przekaże Zamawiającemu uzyskane surowe dane na nośniku elektronicznym bez analizy statystycznej uzyskanych wyników. D) Dopuszczalny odsetek próbek, dla których niemożliwy jest odczyt surowych danych z głębokiego sekwencjonowania wynosi 3%. E) Wykonawca zapewnia, że wymagana usługa zostanie wykonana przy użyciu urządzeń spełniających wymagania systemu zgodności (certyfikowanych) z odpowiednimi normami dyrektyw UE. 3. Szczegółowo usługa obejmuje: Kontrolę jakości. Przesłanie drogą elektroniczną raportu dotyczącego przeprowadzonej kontroli jakości przesłanego materiału. Przygotowanie biblioteki DNA (ang. DNA library). Wzbogacanie egzomu (ang. exome enrichment). Wytwarzanie klastrów (ang. cluster generation). 4. Wymagania szczególne dla platformy do głębokiego sekwencjonowania: średnia głębokość sekwencjonowania (ang. coverage) - minimum 50 x, przestrzeń tarczowa (ang. target space) minimum 60 Mb (Mb=megazasad), minimum 20.000 genów, minimum 200.000 egzonów, 5. Próbki zostaną przesłane przez Zamawiającego na adres Wykonawcy wskazany w formularzu oferty. 6. Próbki zostaną przesłane do Wykonawcy na koszt Zamawiającego przesyłką kurierską w coolerach (schłodzone + 4-8°C). 7. Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca potwierdza mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 30 dni robocze.

Kody CPV: 733110006

Kod trybu postepowania: PN

Czy zamówienie dotyczy programu UE: Tak

nazwa programu UE:
w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013.

Nazwa wykonawcy:
Source BioScience UK Limited,

NG8 6PX, UK
Company Reg No 4078501

Adres pocztowy wykonawcy: 1 Orchard Place, Nottingham Business Park,

Miejscowość: Nottingham

ID województwa: 47

Województwo / kraj: Zjednoczone Królestwo

Nazwa:
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu

Nr częsci: 1

Data udzielenie zamówienia: 27/03/2012

Liczba ofert: 3

Liczba odrzuconych ofert: 2

Szacunkowa wartość zamówienia: 532901,03

Cena wybranej oferty: 589390,10

Cena minimalna: 589390,10

Cena maksymalna: 773837,28

Kod waluty: 1

Waluta (PLN): PLN

Podobne przetargi

271473 / 2012-12-21 - Uczelnia publiczna

Gdański Uniwersytet Medyczny - Gdańsk (pomorskie)
CPV: 733110006 ()
ZP/147/2012 Wykonanie usługi genotypowania polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP)

29357 / 2012-02-03 - Uczelnia publiczna

Gdański Uniwersytet Medyczny - Gdańsk (pomorskie)
CPV: 733110006 ()
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu

428196 / 2012-10-31 - Uczelnia publiczna

Gdański Uniwersytet Medyczny - Gdańsk (pomorskie)
CPV: 733110006 ()
ZP/147/2012 Wykonanie usługi genotypowania polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP)