92629 / 2012-04-24 - Uczelnia publiczna / Gdański Uniwersytet Medyczny (Gdańsk)
Ogłoszenie zawiera informacje aktualizacyjne dotyczące publikacji w biuletynie 1 z dnia 2012-02-03 pod pozycją 29357. Zobacz ogłoszenie 29357 / 2012-02-03 - Uczelnia publiczna.
Numer biuletynu: 1
Pozycja w biuletynie: 92629
Data publikacji: 2012-04-24
Nazwa: Gdański Uniwersytet Medyczny
Ulica: ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a
Numer domu: 3a
Miejscowość: Gdańsk
Kod pocztowy: 80-210
Województwo / kraj: pomorskie
Numer telefonu: (058) 349 12 23
Numer faxu: (058) 349 12 24
Adres strony internetowej: www.gumed.edu.pl
Regon: 00028862700000
Typ ogłoszenia: ZP-403
Numer biuletynu: 1
Numer pozycji: 29357
Data wydania biuletynu: 2012-02-03
Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak
Czy zamówienie było ogłoszone w BZP: Tak
Rok ogłoszenia: 2012
Pozycja ogłoszenia: 29357
Czy w BZP zostało zamieszczone ogłoszenie o zmianie: Tak
Ogłoszenie dotyczy: 1
Rodzaj zamawiającego: Uczelnia publiczna
Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu
Rodzaj zamówienia: U
Przedmiot zamówienia:
1. Przedmiotem zamówienia jest usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013; 2. Wykonawca zapewni: A) wykonanie usługi metodą głębokiego sekwencjonowania (ang. next generation sequencing) DNA dla egzomu - dostarczonego przez zamawiającego materiału: 144 próbek DNA wyizolowanych z ludzkich kożuszków leukocytarnych standardowym zestawem firmy Qiagen (QIAamp DNA Blood Mini kit, nr kat 51104), w tym: egzonów genów kodujących białka, regionów nie ulegających translacji (sekwencje 3 i 5 UTR), niekodujących krótkich RNA, (w tym sekwencji kodujących, wymienionych w załączniku nr 4 do SIWZ - lista mikroRNA. B) Wśród analizowanych próbek będą 2 powtórzone próbki (tj. po 2 próbki od 2 pacjentów). C) Wykonawca przekaże Zamawiającemu uzyskane surowe dane na nośniku elektronicznym bez analizy statystycznej uzyskanych wyników. D) Dopuszczalny odsetek próbek, dla których niemożliwy jest odczyt surowych danych z głębokiego sekwencjonowania wynosi 3%. E) Wykonawca zapewnia, że wymagana usługa zostanie wykonana przy użyciu urządzeń spełniających wymagania systemu zgodności (certyfikowanych) z odpowiednimi normami dyrektyw UE. 3. Szczegółowo usługa obejmuje: Kontrolę jakości. Przesłanie drogą elektroniczną raportu dotyczącego przeprowadzonej kontroli jakości przesłanego materiału. Przygotowanie biblioteki DNA (ang. DNA library). Wzbogacanie egzomu (ang. exome enrichment). Wytwarzanie klastrów (ang. cluster generation). 4. Wymagania szczególne dla platformy do głębokiego sekwencjonowania: średnia głębokość sekwencjonowania (ang. coverage) - minimum 50 x, przestrzeń tarczowa (ang. target space) minimum 60 Mb (Mb=megazasad), minimum 20.000 genów, minimum 200.000 egzonów, 5. Próbki zostaną przesłane przez Zamawiającego na adres Wykonawcy wskazany w formularzu oferty. 6. Próbki zostaną przesłane do Wykonawcy na koszt Zamawiającego przesyłką kurierską w coolerach (schłodzone + 4-8°C). 7. Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca potwierdza mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 30 dni robocze.
Kody CPV: 733110006
Kod trybu postepowania: PN
Czy zamówienie dotyczy programu UE: Tak
nazwa programu UE:
w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013.
Nazwa wykonawcy:
Source BioScience UK Limited,
NG8 6PX, UK
Company Reg No 4078501
Adres pocztowy wykonawcy: 1 Orchard Place, Nottingham Business Park,
Miejscowość: Nottingham
ID województwa: 47
Województwo / kraj: Zjednoczone Królestwo
Nazwa:
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu
Nr częsci: 1
Data udzielenie zamówienia: 27/03/2012
Liczba ofert: 3
Liczba odrzuconych ofert: 2
Szacunkowa wartość zamówienia: 532901,03
Cena wybranej oferty: 589390,10
Cena minimalna: 589390,10
Cena maksymalna: 773837,28
Kod waluty: 1
Waluta (PLN): PLN
Podobne przetargi
271473 / 2012-12-21 - Uczelnia publiczna
Gdański Uniwersytet Medyczny - Gdańsk (pomorskie)
CPV: 733110006 ()
ZP/147/2012 Wykonanie usługi genotypowania polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP)
29357 / 2012-02-03 - Uczelnia publiczna
Gdański Uniwersytet Medyczny - Gdańsk (pomorskie)
CPV: 733110006 ()
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu
428196 / 2012-10-31 - Uczelnia publiczna
Gdański Uniwersytet Medyczny - Gdańsk (pomorskie)
CPV: 733110006 ()
ZP/147/2012 Wykonanie usługi genotypowania polimorfizmów
pojedynczego nukleotydu (SNP)