29357 / 2012-02-03 - Uczelnia publiczna / Gdański Uniwersytet Medyczny (Gdańsk)

Oryginalny ColorStix 16204100 (2 kostki) Niebieski marki Xerox

Cena: 412.05 PLN

ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu

Opis zamówienia

1. Przedmiotem zamówienia jest usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013;

2. Wykonawca zapewni:
A) wykonanie usługi metodą głębokiego sekwencjonowania (ang. next generation sequencing) DNA dla egzomu - dostarczonego przez zamawiającego materiału: 144 próbek DNA wyizolowanych z ludzkich kożuszków leukocytarnych standardowym zestawem firmy Qiagen (QIAamp DNA Blood Mini kit, nr kat 51104), w tym:
egzonów genów kodujących białka,
regionów nie ulegających translacji (sekwencje 3 i 5 UTR),
niekodujących krótkich RNA, (w tym sekwencji kodujących, wymienionych w załączniku nr 4 do SIWZ - lista mikroRNA.

B) Wśród analizowanych próbek będą 2 powtórzone próbki (tj. po 2 próbki od 2 pacjentów).
C) Wykonawca przekaże Zamawiającemu uzyskane surowe dane na nośniku elektronicznym bez analizy statystycznej uzyskanych wyników.
D) Dopuszczalny odsetek próbek, dla których niemożliwy jest odczyt surowych danych z głębokiego sekwencjonowania wynosi 3%.
E) Wykonawca zapewnia, że wymagana usługa zostanie wykonana przy użyciu urządzeń spełniających wymagania systemu zgodności (certyfikowanych) z odpowiednimi normami dyrektyw UE.
3. Szczegółowo usługa obejmuje:
Kontrolę jakości.
Przesłanie drogą elektroniczną raportu dotyczącego przeprowadzonej kontroli jakości przesłanego materiału.
Przygotowanie biblioteki DNA (ang. DNA library).
Wzbogacanie egzomu (ang. exome enrichment).
Wytwarzanie klastrów (ang. cluster generation).

4. Wymagania szczególne dla platformy do głębokiego sekwencjonowania:
średnia głębokość sekwencjonowania (ang. coverage) - minimum 50 x,
przestrzeń tarczowa (ang. target space) minimum 60 Mb (Mb=megazasad),
minimum 20.000 genów, minimum 200.000 egzonów,

5. Próbki zostaną przesłane przez Zamawiającego na adres Wykonawcy wskazany w formularzu oferty.

6. Próbki zostaną przesłane do Wykonawcy na koszt Zamawiającego przesyłką kurierską w coolerach (schłodzone + 4-8°C).

7. Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca potwierdza mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 30 dni robocze.

Numer biuletynu: 1

Pozycja w biuletynie: 29357

Data publikacji: 2012-02-03

Nazwa: Gdański Uniwersytet Medyczny

Ulica: ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a

Numer domu: 3a

Miejscowość: Gdańsk

Kod pocztowy: 80-210

Województwo / kraj: pomorskie

Numer telefonu: (058) 349 12 23

Numer faxu: (058) 349 12 24

Adres strony internetowej: www.gumed.edu.pl

Regon: 00028862700000

Typ ogłoszenia: ZP-400

Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak

Ogłoszenie dotyczy: 1

Rodzaj zamawiającego: Uczelnia publiczna

Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu

Rodzaj zamówienia: U

Przedmiot zamówienia:
1. Przedmiotem zamówienia jest usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013;

2. Wykonawca zapewni:
A) wykonanie usługi metodą głębokiego sekwencjonowania (ang. next generation sequencing) DNA dla egzomu - dostarczonego przez zamawiającego materiału: 144 próbek DNA wyizolowanych z ludzkich kożuszków leukocytarnych standardowym zestawem firmy Qiagen (QIAamp DNA Blood Mini kit, nr kat 51104), w tym:
egzonów genów kodujących białka,
regionów nie ulegających translacji (sekwencje 3 i 5 UTR),
niekodujących krótkich RNA, (w tym sekwencji kodujących, wymienionych w załączniku nr 4 do SIWZ - lista mikroRNA.

B) Wśród analizowanych próbek będą 2 powtórzone próbki (tj. po 2 próbki od 2 pacjentów).
C) Wykonawca przekaże Zamawiającemu uzyskane surowe dane na nośniku elektronicznym bez analizy statystycznej uzyskanych wyników.
D) Dopuszczalny odsetek próbek, dla których niemożliwy jest odczyt surowych danych z głębokiego sekwencjonowania wynosi 3%.
E) Wykonawca zapewnia, że wymagana usługa zostanie wykonana przy użyciu urządzeń spełniających wymagania systemu zgodności (certyfikowanych) z odpowiednimi normami dyrektyw UE.
3. Szczegółowo usługa obejmuje:
Kontrolę jakości.
Przesłanie drogą elektroniczną raportu dotyczącego przeprowadzonej kontroli jakości przesłanego materiału.
Przygotowanie biblioteki DNA (ang. DNA library).
Wzbogacanie egzomu (ang. exome enrichment).
Wytwarzanie klastrów (ang. cluster generation).

4. Wymagania szczególne dla platformy do głębokiego sekwencjonowania:
średnia głębokość sekwencjonowania (ang. coverage) - minimum 50 x,
przestrzeń tarczowa (ang. target space) minimum 60 Mb (Mb=megazasad),
minimum 20.000 genów, minimum 200.000 egzonów,

5. Próbki zostaną przesłane przez Zamawiającego na adres Wykonawcy wskazany w formularzu oferty.

6. Próbki zostaną przesłane do Wykonawcy na koszt Zamawiającego przesyłką kurierską w coolerach (schłodzone + 4-8°C).

7. Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca potwierdza mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 30 dni robocze.

Kody CPV: 733110006

Czy zamówienie jest podzielone na części: Nie

Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej: Nie

Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających: Tak

Określenie zamówień uzupełniających:
Zamawiający przewiduje udzielenie zamówień uzupełniających - do 50% zamówienia podstawowego

Czas: O

Okres trwania zamówienia w dniach: 60

Zaliczka: Nie

Wiedza i doświadczenie:
1. O udzielenie zamówienia mogą ubiegać się Wykonawcy, którzy spełniają warunki dotyczące:
2) posiadania wiedzy i doświadczenia tj.;
Zamawiający uzna warunek za spełniony, jeżeli Wykonawca wykaże się wykonaniem w okresie ostatnich 3 lat przed upływem terminu składania ofert, a jeżeli okres prowadzenia działalności jest krótszy - w tym okresie:
co najmniej 3 (trzy) analizy głębokiego sekwencjonowania z czego każda analiza na kwotę nie mniejszą niż 400.000zł netto, w tym co najmniej jedno sekwencjonowanie egzomu.

Oświadczenie nr 3: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 1: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 2: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 7: Tak

Dokumenty podmiotów zagranicznych: Tak

III.7 osoby niepełnosprawne: Nie

Kod trybu postepowania: PN

Czy zmiana umowy: Tak

Zmiana umowy:
ZMIANY UMOWY
1. Zamawiający przewiduje możliwość zmian umowy w sytuacji:
a) gdy dochowanie terminu umownego jest niemożliwe z uwagi na siłę wyższą lub inne okoliczności niezależne od Wykonawcy lub których Wykonawca przy zachowaniu należytej staranności nie był w stanie uniknąć lub przewidzieć.
Przez siłę wyższą strony rozumieją okoliczności niemożliwe do przewidzenia w chwili zawierania umowy, niezależne od woli stron, na których powstanie żadna ze stron nie miała wpływu i których powstaniu nie mogła zapobiec. Za siłę wyższą uważa się w szczególności: klęski żywiołowe, katastrofy, mobilizację, embargo, zamknięcie granic.
Wykonawca dotknięty działaniem siły wyższej jest zobowiązany do niezwłocznego powiadomienia o tym fakcie Zamawiającego,
b) w przypadku zmiany adresu, nazwy Wykonawcy lub Zamawiającego, dopuszcza się zmiany w tym zakresie,
c) w innych wypadkach, gdy zmiany nie są istotne.
2. Wszelkie zmiany niniejszej umowy wymagają formy pisemnej pod rygorem nieważności.

Kod kryterium cenowe: A

Czy wykorzystywana będzie aukcja: Nie

Adres strony internetowej specyfikacji i warunków zamówienia: www.gumed.edu.pl

Adres uzyskania specyfikacji i warunków zamówienia:
www.gumed.edu.pl oraz nieodpłatnie w Zespole Zamówień Publicznych Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, budynek Rektoratu III piętro, pok. 313, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk

Data składania wniosków, ofert: 13/02/2012

Godzina składania wniosków, ofert: 09:00

Miejsce składania:
Zespole Zamówień Publicznych Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, budynek Rektoratu III piętro, pok. 313, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk

On: O

Termin związania ofertą, liczba dni: 30

Informacje dodatkowe:
w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013

Czy unieważnienie postępowania: Nie

Podobne przetargi