12651 / 2014-01-20 - Inny: Instytut Polskiej Akademii Nauk / Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk (Poznań)

Numer biuletynu: 1

Pozycja w biuletynie: 12651

Data publikacji: 2014-01-20

Nazwa:
Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk

Ulica: ul. Noskowskiego 12/14

Numer domu: 12/14

Miejscowość: Poznań

Kod pocztowy: 61-704

Województwo / kraj: wielkopolskie

Numer telefonu: 061 8582091

Numer faxu: 061 8525954

Adres strony internetowej:
www.ibch.poznan.pl - zakładka zamówienia publiczne lub www.man.poznan.pl/pcss/public/zampub

Regon: 00000000849327

Typ ogłoszenia: ZP-408

Rodzaj zamawiającego: Inny: Instytut Polskiej Akademii Nauk

Inny rodzaj zamawiającego: Instytut Polskiej Akademii Nauk

Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
SEKWENCJONOWANIE GENOMÓW DWÓCH LINII KUKURYDZY ZWYCZAJNEJ
(Pacbio RS version II)

Rodzaj zamówienia: U

Przedmiot zamówienia:
Sekwencjonowanie genomów dwóch linii kukurydzy zwyczajnej (Pacbio RS version II) w niżej podanym asortymencie i ilości:
1. Izolacja DNA z dwóch linii kukurydzy zwyczajnej
- rozbicie komórek (liza (jeśli potrzebne)
- izolacja DNA
- analiza jakościowa i ilościowa (żel agarozowy)
2. Utworzenie (przygotowanie) bibliotek PacBio RS
- fragmentacja DNA
- wybór fragmentów o odpowiedniej długości (8-12 kb)
- naprawa końców i ligacja adapterów
- wydłużanie primerów
- wydłużanie polimerazy
3. Sekwencjonowanie na PacBio RS: 200 Mb surowych danych
- specyfikacja na jednostkę (60 jednostek na linię kukurydzy, 120 jednostek w sumie)
- surowych danych większy niż 200 Mb (12 Gb wyprodukowanych dla jednej linii)
- średnia ,typowa długość odczytów większy niż 4000 bp
Dostarczenie:
- surowych danych (fastq, bas. h5, metadata.xml)

Kody CPV:
731100006 (Usługi badawcze)

szacunkowa_wart_zam: Tak

Kod trybu postepowania: WR

zamowienie_pprawna_hid: c;

zamowienie_pprawna: art. 67 ust. 1 pkt 1 lit. a

zamowienie_uzasadnienie:
uzasadnienie prawne:
Działając zgodnie z art. 67 ust.1 pkt.1a Pzp, Zamawiający może udzielić zamówienia z wolnej ręki, jeżeli dostawy, usługi lub roboty budowlane mogą być świadczone tylko przez jednego wykonawcę z przyczyn technicznych o obiektywnym charakterze. Podstawą zastosowania tej przesłanki wyboru trybu udzielenia zamówienia jest szczególny charakter zamówienia powodujący, że może ono być zrealizowane tylko przez jednego wykonawcę.
Zamówienia zamierza udzielić się wykonawcy, który posiada wyłączne prawo do wykonywania sekwencjonowania w technologii PacBio SMRT II
uzasadnienie faktyczne:
Zamawiana w firmie GATC usługa sekwencjonowania ysokoprzepustowego wykonywana będzie w technologii PacBio SMRT II. Technologia ta zapewnia unikatowe możliwości otrzymania odczytów o długości kilkunastu tysięcy par zasad. Takie odczyty są niezbędne do poprawnego złożenia genomów kukurydzy zawierających znaczne ilości sekwencji powtórzonych. Firma GATC jest jedynym komercyjnym wykonawcą sekwencjonowania w technologii PacBio SMRT II w Europie.

Nazwa wykonawcy:
GATC Biotech
European Genome and Diagnostics Centre
Jakob-Stadler-Platz 7
78467 Konstanz
Germany

Adres pocztowy wykonawcy: Jakob-Stadler-Platz 7

Miejscowość: 78467 Konstanz

ID województwa: 37

Województwo / kraj: Niemcy

Podobne przetargi