136752 / 2011-05-31 - Uczelnia publiczna / Uniwersytet Medyczny w Lublinie (Lublin)

Oryginalny toner CRG-711M Purpurowy marki Canon

Cena: 701.10 PLN

Dostawa pakietów oprogramowania statystycznego; Nr sprawy UM-ZP-262-57/11

Opis zamówienia

1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa pakietów oprogramowania statystycznego tj. analityczne lub naukowe pakiety oprogramowania; matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania. W w przedmiot zamówienia będzie realizowany w dwóch następujących zadaniach:
Zadanie nr 1 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH - 1 szt.
Zadanie nr 2 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnej miRNA - 1 szt.
2. Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji).
3. Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne.
4. Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale. IV SIWZ
5. Ewentualne wskazanie przez zamawiającego nazwy, producenci maja na celu określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służą ustaleniu standardu nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta.
6. Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego.
Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia:
Zadanie nr 1
Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber
Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH
Parametry wymagane
1. Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne.
2. Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów.
3. Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap
4. Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie.
5. Oprogramowanie obliczające QC próbki.
6. Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi.
7. Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi.
8. Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek.
9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera.
10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie.
11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH.
12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu.
13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria.
14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu.
15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia).
16.Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp).
17. Certyfikat potwierdzający zaawansowaną znajomość oprogramowania.
18.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu
Zadanie nr 2
Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus
Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA
1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA TM microRNA Array.
2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan.
3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA TM MicroRNA.
4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną.
5.Oprogramowanie obliczające QC próbki.
6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA.
7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi.
8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek.
9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera.
10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA.
11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia.
12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu.

Numer biuletynu: 1

Pozycja w biuletynie: 136752

Data publikacji: 2011-05-31

Nazwa: Uniwersytet Medyczny w Lublinie

Ulica: Al. Racławickie 1

Numer domu: 1

Miejscowość: Lublin

Kod pocztowy: 20-059

Województwo / kraj: lubelskie

Numer telefonu: 81 528 88 88

Numer faxu: 81 528 89 18

Adres strony internetowej: www.am.lublin.pl

Regon: 00028871600000

Typ ogłoszenia: ZP-400

Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak

Ogłoszenie dotyczy: 1

Rodzaj zamawiającego: Uczelnia publiczna

Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
Dostawa pakietów oprogramowania statystycznego; Nr sprawy UM-ZP-262-57/11

Rodzaj zamówienia: D

Przedmiot zamówienia:
1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa pakietów oprogramowania statystycznego tj. analityczne lub naukowe pakiety oprogramowania; matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania. W w przedmiot zamówienia będzie realizowany w dwóch następujących zadaniach:
Zadanie nr 1 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH - 1 szt.
Zadanie nr 2 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnej miRNA - 1 szt.
2. Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji).
3. Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne.
4. Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale. IV SIWZ
5. Ewentualne wskazanie przez zamawiającego nazwy, producenci maja na celu określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służą ustaleniu standardu nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta.
6. Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego.
Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia:
Zadanie nr 1
Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber
Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH
Parametry wymagane
1. Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne.
2. Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów.
3. Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap
4. Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie.
5. Oprogramowanie obliczające QC próbki.
6. Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi.
7. Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi.
8. Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek.
9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera.
10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie.
11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH.
12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu.
13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria.
14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu.
15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia).
16.Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp).
17. Certyfikat potwierdzający zaawansowaną znajomość oprogramowania.
18.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu
Zadanie nr 2
Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus
Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA
1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA TM microRNA Array.
2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan.
3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA TM MicroRNA.
4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną.
5.Oprogramowanie obliczające QC próbki.
6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA.
7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi.
8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek.
9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera.
10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA.
11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia.
12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu.

Czy zamówienie jest podzielone na części: Tak

Ilość części: 2

Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej: Nie

Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających: Nie

Czas: O

Okres trwania zamówienia w dniach: 7

Informacja na temat wadium: Nie dotyczy

Zaliczka: Nie

Uprawnienia: Oswiadczenie Wykonawcy

Wiedza i doświadczenie: Oswiadczenie Wykonawcy

Potencjał techniczny: Oswiadczenie Wykonawcy

Osoby zdolne do zrealizowania zamówienia: Oswiadczenie Wykonawcy

Sytuacja ekonomiczna: Oswiadczenie Wykonawcy

Oświadczenie wykluczenia nr 1: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 2: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 7: Tak

Dokumenty podmiotów zagranicznych: Tak

Dokument potwierdzenia III.5: Tak

Inne dokumenty potwierdzające III.5:
1.Zamawiający wymaga, aby oferowany przedmiot zamówienia odpowiadał ( odpowiednio dla zadań na które składana jest oferta):
1.1Wymaganiom określonym przez Zamawiającego w SIWZ
2.W celu potwierdzenia, że oferowane produkty odpowiadają wymaganiom określonym przez Zamawiającego w pkt. 1 w ofercie należy złożyć, odpowiednio dla zadań na które składana jest oferta:
2.1. Dokumenty ( certyfikaty) potwierdzające zaawansowaną znajomość oprogramowania. - w zakresie zadania nr 1 i 2
Zaleca się aby dokumenty były opisane z podaniem którego zadania dotyczą.

inne_dokumenty:
1. Jeżeli Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania poza terytorium Rzeczypospolitej Polskiej, stosownie do treści § 4 ust. 1 rozporządzenia, zamiast dokumentów, o których mowa w punkcie III 4.2 - Wykonawca składa dokument lub dokumenty, wystawione w kraju, w którym ma siedzibę lub miejsce zamieszkania, potwierdzające odpowiednio, że nie otwarto jego likwidacji ani nie ogłoszono upadłości;
2. Dokumenty, o których mowa w pkt. 1 powinny być wystawione nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania ofert.
3. Jeżeli w miejscu zamieszkania osoby lub w kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania, nie wydaje się dokumentów, o których mowa
w pkt. 1, zastępuje się je dokumentem zawierającym oświadczenie złożone przed notariuszem, właściwym organem sądowym, administracyjnym albo organem samorządu zawodowego lub gospodarczego odpowiednio miejsca zamieszkania osoby lub kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania. Zapis pkt. 2. stosuje się odpowiednio. Dokument ten winien być wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania ofert.
4. W przypadku wątpliwości, co do treści dokumentu złożonego przez Wykonawcę mającego siedzibę lub miejsce zamieszkania poza terytorium Rzeczypospolitej Polskiej, Zamawiający może zwrócić się do właściwych organów odpowiednio miejsca zamieszkania osoby lub kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania z wnioskiem o udzielenie niezbędnych informacji dotyczących przedłożonego dokumentu.
5.Jeżeli Wykonawca, polega na wiedzy i doświadczeniu, potencjale technicznym, osobach zdolnych do wykonania zamówienia lub zdolnościach finansowych innych podmiotów, to zobowiązany jest również przedłożyć:
5.1. Pisemne zobowiązanie tych podmiotów do oddania mu do dyspozycji niezbędnych zasobów na okres korzystania z nich przy wykonywaniu zamówienia;
5.2 Oświadczenie i dokumenty dotyczące tych podmiotów, wymienione w punkcie III 4.2.

III.7 osoby niepełnosprawne: Nie

Kod trybu postepowania: PN

Czy zmiana umowy: Tak

Zmiana umowy:
1. Zmiana postanowień niniejszej umowy może nastąpić w formie pisemnego aneksu pod rygorem nieważności w następujących przypadkach:
1.1. aktualizacji rozwiązań ze względu na postęp technologiczny ( np. wycofanie z obrotu) zmiana nie może powodować zmiany ceny wynikającej oferty na podstawie której był dokonany wybór wykonawcy
1.2. zmiany obowiązujących przepisów, jeżeli konieczne będzie dostosowanie treści umowy do aktualnego stanu prawnego;
1.3. zmiany stawki podatku VAT. Cena brutto ulegnie zmniejszeniu w przypadku obniżenia stawki podatku od towarów i usług lub powiększeniu w przypadku podwyższenia stawki podatku od towarów i usług.
1.4. konieczności zmiany terminu realizacji przedmiotu umowy z przyczyn niezawinionych przez strony, zmiana nie może spowodować zmiany ceny wynikającej z oferty Wykonawcy;
1.5. konieczności zmiany osób przewidzianych do wzajemnego współdziałania, lub wykonania przedmiotu umowy;
1.6. wystąpienia zdarzeń siły wyższej jako zdarzenia zewnętrznego, niemożliwego do przewidzenia i niemożliwego do zapobieżenia;
1.7. wprowadzenia nowej technologii, lub innych okoliczności pozwalających na obniżenie ceny przedmiotu umowy, Wykonawca powinien ją odpowiednio obniżyć;
1.8. konieczności zastąpienia przedmiotem równoważnym lub o wyższych parametrach jakościowych
2. Inicjatorem zmian może być Zamawiający lub Wykonawca poprzez pisemne wystąpienie w okresie obowiązywania umowy zawierające uzasadnienie proponowanych zmian.

Kod kryterium cenowe: A

Czy wykorzystywana będzie aukcja: Nie

Adres strony internetowej specyfikacji i warunków zamówienia: www.umlub.pl

Adres uzyskania specyfikacji i warunków zamówienia: 1) strona interentowa j.w.

Data składania wniosków, ofert: 08/06/2011

Godzina składania wniosków, ofert: 10:30

Miejsce składania:
siedziba zamawiającego Al. Racłwickie 1 20 -059 Lublin pok 22. ( Kancelaria Ogólna)

On: O

Termin związania ofertą, liczba dni: 30

Informacje dodatkowe: Nie dotyczy

Czy unieważnienie postępowania: Nie

Numer części zamówienia: 1

Nazwa: Zadanie nr 1

Opis:
1.Przedmiotem zamówienia jest dostawa pakietów oprogramowania statystycznego tj. analityczne lub naukowe pakiety oprogramowania; matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania. W/w przedmiot zamówienia będzie realizowany w dwóch następujących zadaniach:
Zadanie nr 1 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH - 1 szt.
Zadanie nr 2 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnej miRNA - 1 szt.
2.Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji).
3.Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne.
4.Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale. IV SIWZ
5.Ewentualne wskazanie przez zamawiającego nazwy, producenci maja na celu określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służą ustaleniu standardu nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta.
6.Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego.
Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia:
Zadanie nr 1
Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber
Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH
Parametry wymagane
1.Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne.
2.Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów.
3.Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap
4.Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie.
5.Oprogramowanie obliczające QC próbki.
6.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi.
7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi.
8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek.
9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera.
10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie.
11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH.
12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu.
13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria.
14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu.
15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach/regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia).
16. Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp).
17.Certyfikat potwierdzający zaawansowaną znajomość oprogramowania.
18.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu

Kody CPV:
484630001 (Pakiety oprogramowania statystycznego)

Kod CPV drugiej częsci zamówienia: 484640007

Kod CPV trzeciej częsci zamówienia:
484620004 (Matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)

Czas: O

Okres trwania zamówienia w dniach: 7

Kod kryterium cenowe: A

Numer części zamówienia: 2

Nazwa: Zadanie nr 2

Opis:
1.Przedmiotem zamówienia jest dostawa pakietów oprogramowania statystycznego tj. analityczne lub naukowe pakiety oprogramowania; matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania. W/w przedmiot zamówienia będzie realizowany w dwóch następujących zadaniach:
Zadanie nr 1 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH - 1 szt.
Zadanie nr 2 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnej miRNA - 1 szt.
2.Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji).
3.Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne.
4.Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale. IV SIWZ
5.Ewentualne wskazanie przez zamawiającego nazwy, producenci maja na celu określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służą ustaleniu standardu nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta.
6.Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego.
Zadanie nr 2
Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus
Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA
1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA TM microRNA Array.
2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan.
3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA TM MicroRNA.
4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną.
5.Oprogramowanie obliczające QC próbki.
6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA.
7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi.
8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek.
9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera.
10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA.
11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia.
12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu.

Kody CPV:
484630001 (Pakiety oprogramowania statystycznego)

Kod CPV drugiej częsci zamówienia: 484640007

Kod CPV trzeciej częsci zamówienia:
484620004 (Matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)

Czas: O

Okres trwania zamówienia w dniach: 7

Kod kryterium cenowe: A

Kody CPV:
484630001 (Pakiety oprogramowania statystycznego)

Kod CPV drugiej częsci zamówienia: 484640007

Kod CPV trzeciej częsci zamówienia:
484620004 (Matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)

Podobne przetargi