262312 / 2015-10-05 - Podmiot prawa publicznego / Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polska Akademia Nauk (Wrocław)

Oryginalny tusz foto T087140 Czarny marki Epson

Cena: 66.42 PLN

WYKONANIE USŁUG BADAWCZYCH ORAZ EKSPERTYZ NIEZBĘDNYCH DO PRAWIDŁOWEJ REALIZACJI PROJEKTU MULTIGENBANK

Opis zamówienia

Przedmiotem zamówienia jest wykonanie usług badawczych oraz ekspertyz niezbędnych do prawidłowej realizacji projektu, w ramach przygotowania i konwersji danych scharakteryzowanych pod względem różnego typu polimorfizmów genetycznych.
I. Przedmiot zamówienia podzielono na 3 zadania:
Zadanie 1: Weryfikacja danych, selekcja i grupowania informacji z zakresu systematyki i taksonomii molekularnej na tle danych dostępnych globalnie.
Przedmiotem zamówienia jest weryfikacja i analiza danych genetycznych mikroorganizmów umieszczanych w bazie multigenbank. W ramach zamówienia wykonawca zweryfikuje sekwencje nukleotydowe o długości do 1600 nukleotydów w ilości 2700 z materiału dostarczonego przez zamawiającego. Wymagana jest jednokrotna weryfikacja z obydwu końców sekwencji.
Efektem usługi powinno być uzyskanie danych o sekwencjach nukleotydowych.
Zadanie 2: Zaawansowana analiza bioinformatyczna sekwencji/informacji o metabolitach bakteryjnych
Przedmiotem zamówienia jest analiza działania i możliwości stosowania algorytmu wspomagającego projektowanie syntetycznych sekwencji nukleotydowych kodujących białka syntaz poliketydowych. Algorytm ma mieć zastosowanie w ukierunkowanym uzyskiwaniu metabolitów wtórnych metodami biologii syntetycznej. W ramach usługi ma być zweryfikowana miedzy innymi poprawność tworzenia sekwencji i zgodność struktury projektowanych związków ze strukturami uzyskiwanymi. W tym celu powinno zostać przeanalizowanych wiele różnorodnych przypadków funkcjonowania tego algorytmu.
Zadanie 3: Kompleksowa analiza wykonana techniką mikromacierzy
Przedmiotem zamówienia jest kompleksowa analiza profilu porównawczej hybrydyzacji genomowej (aCGH) dla 24 próbek DNA oraz wyznaczenie profilu ekspresji polimorficznych genów z wykorzystaniem 40 par próbek RNA (próbka referencyjna oraz próbka badana) pochodzących od 40 pacjentów z wykorzystaniem techniki mikromacierzy wraz z analizą i interpretacją wyników.

Zamawiający dopuszcza składanie ofert częściowych na dowolną ilość zadań.

Numer biuletynu: 1

Pozycja w biuletynie: 262312

Data publikacji: 2015-10-05

Nazwa:
Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polska Akademia Nauk

Ulica: ul. Rudolfa Weigla 12

Numer domu: 12

Miejscowość: Wrocław

Kod pocztowy: 53-114

Województwo / kraj: dolnośląskie

Numer telefonu: 71 3709997

Numer faxu: 71 3709997

Adres strony internetowej: www.iitd.pan.wroc.pl

Regon: 00032588300000

Typ ogłoszenia: ZP-400

Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak

Ogłoszenie dotyczy: 1

Rodzaj zamawiającego: Podmiot prawa publicznego

Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
WYKONANIE USŁUG BADAWCZYCH ORAZ EKSPERTYZ NIEZBĘDNYCH DO PRAWIDŁOWEJ REALIZACJI PROJEKTU MULTIGENBANK

Rodzaj zamówienia: U

Przedmiot zamówienia:
Przedmiotem zamówienia jest wykonanie usług badawczych oraz ekspertyz niezbędnych do prawidłowej realizacji projektu, w ramach przygotowania i konwersji danych scharakteryzowanych pod względem różnego typu polimorfizmów genetycznych.
I. Przedmiot zamówienia podzielono na 3 zadania:
Zadanie 1: Weryfikacja danych, selekcja i grupowania informacji z zakresu systematyki i taksonomii molekularnej na tle danych dostępnych globalnie.
Przedmiotem zamówienia jest weryfikacja i analiza danych genetycznych mikroorganizmów umieszczanych w bazie multigenbank. W ramach zamówienia wykonawca zweryfikuje sekwencje nukleotydowe o długości do 1600 nukleotydów w ilości 2700 z materiału dostarczonego przez zamawiającego. Wymagana jest jednokrotna weryfikacja z obydwu końców sekwencji.
Efektem usługi powinno być uzyskanie danych o sekwencjach nukleotydowych.
Zadanie 2: Zaawansowana analiza bioinformatyczna sekwencji/informacji o metabolitach bakteryjnych
Przedmiotem zamówienia jest analiza działania i możliwości stosowania algorytmu wspomagającego projektowanie syntetycznych sekwencji nukleotydowych kodujących białka syntaz poliketydowych. Algorytm ma mieć zastosowanie w ukierunkowanym uzyskiwaniu metabolitów wtórnych metodami biologii syntetycznej. W ramach usługi ma być zweryfikowana miedzy innymi poprawność tworzenia sekwencji i zgodność struktury projektowanych związków ze strukturami uzyskiwanymi. W tym celu powinno zostać przeanalizowanych wiele różnorodnych przypadków funkcjonowania tego algorytmu.
Zadanie 3: Kompleksowa analiza wykonana techniką mikromacierzy
Przedmiotem zamówienia jest kompleksowa analiza profilu porównawczej hybrydyzacji genomowej (aCGH) dla 24 próbek DNA oraz wyznaczenie profilu ekspresji polimorficznych genów z wykorzystaniem 40 par próbek RNA (próbka referencyjna oraz próbka badana) pochodzących od 40 pacjentów z wykorzystaniem techniki mikromacierzy wraz z analizą i interpretacją wyników.

Zamawiający dopuszcza składanie ofert częściowych na dowolną ilość zadań.

Czy zamówienie jest podzielone na części: Tak

Ilość części: 3

Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej: Nie

Czy jest dialog: Nie

Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających: Nie

Czas: O

Okres trwania zamówienia w dniach: 35

Informacja na temat wadium:
Zamawiający określa kwotę wadium w wysokości:
Zadanie 1: 1 000,00 złotych.
Zadanie 2: 800,00 złotych.
Zadanie 3: 2 000,00 złotych.

Zaliczka: Nie

Wiedza i doświadczenie:
Wykonawca spełnia warunek posiadania wiedzy i doświadczenia, jeżeli w okresie ostatnich 3 lat przed upływem terminu składania ofert, a jeżeli okres prowadzenia działalności jest krótszy - w tym okresie wykonał minimum:
Zadanie 1:
- min. 1 usługę polegającą na obsłudze jednostek naukowych w zakresie pozyskiwania i weryfikacji danych z sekwencji nukleotydowych, metodą Sangera.
- posiada certyfikat europejskiej organizacji kontroli jakości potwierdzający prawidłowe wykonywanie techniki sekwencjonownia DNA wystawiony nie wcześniej niż 1 rok przed upływem terminu składania ofert.



Zadanie 2: Zamawiający nie precyzuje szczegółowych wymagań
Zadanie 3: min. 1 usługę w zakresie profilowania ekspresji genów i porównawczej hybrydyzacji genomowej na mikromacierzach oraz umiejętnością analiz bioinformatycznych otrzymanych wyników mikromacierzowych.

Potencjał techniczny:
Wykonawca spełnia warunek dysponowania osobami zdolnymi do wykonania zamówienia, jeżeli przez cały okres realizacji zamówienia będzie dysponował:
Zadanie 1: Dysponować sprzętem dającym możliwość jednoczesnej analizy co najmniej 90 próbek.
Zadanie 2: Zamawiający nie precyzuje szczegółowych wymagań
Zadanie 3: kompletną aparaturę do wykonania i analiz badań na mikromacierzach w tym: bioanalizator, skaner oraz pakiet profesjonalnego oprogramowania do analizy wyników.

Osoby zdolne do zrealizowania zamówienia:
Wykonawca spełnia warunek dysponowania osobami zdolnymi do wykonania zamówienia, jeżeli przez cały okres realizacji zamówienia będzie dysponował:
Zadanie 1: Zamawiający nie precyzuje szczegółowych wymagań
Zadanie 2: osobą zdolną do wykonania zamówienia posiadającymi kwalifikacje i doświadczenie zawodowe, w szczególności:
- Będą posiadać wykształcenie wyższe biologiczne oraz co najmniej tytuł doktora z zakresu nauk biologicznych, udokumentowane co najmniej 3 letnie doświadczenie z zakresu bioinformatyki (min. 10 publikacji, w tym 5 z listy filadelfijskiej).
- osobą posiadającą udokumentowaną wiedzę w zakresie:
-genetyki mikroorganizmów,
-analiz bioinformatycznych,
-algorytmów analizy sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych np. Clustal, Blast,
-budowy baz danych zawierających sekwencje nukleotydowe i aminokwasowe,
-analiz statystycznych sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych
-biochemii metabolitów wtórnych

Zamawiający dopuszcza wykazanie ww. doświadczenia przez jedną lub dwie osoby
Zadanie 3: Zamawiający nie precyzuje szczegółowych wymagań

Oświadczenie nr 4: Tak

Oświadczenie nr 6: Tak

Oświadczenie nr 7: Tak

Oświadczenie nr 9: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 1: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 2: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 3: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 4: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 8: Tak

Dokumenty grupy kapitałowej: Tak

Dokumenty podmiotów zagranicznych: Tak

Dokumenty podmiotów zagranicznych: Tak

III.7 osoby niepełnosprawne: Nie

Kod trybu postepowania: PN

Czy zmiana umowy: Tak

Zmiana umowy:
1) nastąpią istotne zmiany przepisów lub norm mających zastosowanie do przedmiotu zamówienia;
2) nastąpią zmiany obowiązującej stawki VAT, ulec zmianie może cena w takim zakresie w jakim będzie to wynikało z przepisów;
3) zmiany terminu realizacji przedmiotu umowy ze względu na zmiany terminów w Projekcie.
4) w wypadku wystąpienia okoliczności, za które Wykonawca nie ponosi odpowiedzialności, skutkujących niemożnością dotrzymania przez niego terminu realizacji, określonego w umowie. Wówczas termin ten może ulec przedłużeniu, nie więcej jednak niż o czas trwania tych okoliczności.
5) w wypadku, gdy konieczne będzie wprowadzenie zmian dotyczących treści o charakterze in-formacyjnym lub instrukcyjnym, niezbędnym do realizacji Umowy, w szczególności zmian do-tyczących numeru rachunku bankowego Wykonawcy lub Zamawiającego, zmiany osób upoważnionych do komunikowania się, zmiany osób odpowiedzialnych za prawidłową realizację Umowy wraz z adresami, numerami telefonów, telefaksów, adresów poczty elektronicznej, itp.

Kod kryterium cenowe: B

Znaczenie kryterium 1: 60

Nazwa kryterium 2: Termin realizacji zamówienia

Znaczenie kryterium 2: 40

Adres strony internetowej specyfikacji i warunków zamówienia: www.iitd.pan.wroc.pl

Adres uzyskania specyfikacji i warunków zamówienia: www.iitd.pan.wroc.pl

Data składania wniosków, ofert: 13/10/2015

Godzina składania wniosków, ofert: 10:00

Miejsce składania:
Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polska Akademia Nauk; ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław; pok. 152

On: O

Termin związania ofertą, liczba dni: 30

Informacje dodatkowe:
Utworzenie bazy danych immunogenetycznych polskiej populacji MultiGenBank
Nr POIG.02.03.02-02-028/13

Czy unieważnienie postępowania: Nie

Kody CPV:
722400009 (Usługi analizy systemu i programowania)

Kod CPV drugiej częsci zamówienia:
731000003 (Usługi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe)

Numer części zamówienia: 1

Nazwa:
Weryfikacja danych, selekcja i grupowania informacji z zakresu systematyki i taksonomii molekularnej na tle danych dostępnych globalnie

Opis:
Przedmiotem zamówienia jest weryfikacja i analiza danych genetycznych mikroorganizmów umieszczanych w bazie multigenbank. W ramach zamówienia wykonawca zweryfikuje sekwencje nukleotydowe o długości do 1600 nukleotydów w ilości 2700 z materiału dostarczonego przez zamawiającego. Wymagana jest jednokrotna weryfikacja z obydwu końców sekwencji.
Efektem usługi powinno być uzyskanie danych o sekwencjach nukleotydowych.

Kody CPV:
722400009 (Usługi analizy systemu i programowania)

Kod CPV drugiej częsci zamówienia:
731000003 (Usługi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe)

Czas: O

Okres trwania zamówienia w dniach: 35

Kod kryterium cenowe: B

Znaczenie kryterium 1: 60

Nazwa kryterium 2: Termin realizacji zamówienia

Znaczenie kryterium 2: 40

Numer części zamówienia: 2

Nazwa:
Zaawansowana analiza bioinformatyczna sekwencji/informacji o metabolitach bakteryjnych

Opis:
Przedmiotem zamówienia jest analiza działania i możliwości stosowania algorytmu wspomagającego projektowanie syntetycznych sekwencji nukleotydowych kodujących białka syntaz poliketydowych. Algorytm ma mieć zastosowanie w ukierunkowanym uzyskiwaniu metabolitów wtórnych metodami biologii syntetycznej. W ramach usługi ma być zweryfikowana miedzy innymi poprawność tworzenia sekwencji i zgodność struktury projektowanych związków ze strukturami uzyskiwanymi. W tym celu powinno zostać przeanalizowanych wiele różnorodnych przypadków funkcjonowania tego algorytmu.

Kody CPV:
722400009 (Usługi analizy systemu i programowania)

Kod CPV drugiej częsci zamówienia:
731000003 (Usługi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe)

Czas: O

Okres trwania zamówienia w dniach: 35

Kod kryterium cenowe: B

Znaczenie kryterium 1: 60

Nazwa kryterium 2: Termin realizacji zamówienia

Znaczenie kryterium 2: 40

Numer części zamówienia: 3

Nazwa:
Kompleksowa analiza wykonana techniką mikromacierzy

Opis:
Przedmiotem zamówienia jest kompleksowa analiza profilu porównawczej hybrydyzacji genomowej (aCGH) dla 24 próbek DNA oraz wyznaczenie profilu ekspresji polimorficznych genów z wykorzystaniem 40 par próbek RNA (próbka referencyjna oraz próbka badana) pochodzących od 40 pacjentów z wykorzystaniem techniki mikromacierzy wraz z analizą i interpretacją wyników.

Kody CPV:
722400009 (Usługi analizy systemu i programowania)

Kod CPV drugiej częsci zamówienia:
731000003 (Usługi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe)

Czas: O

Okres trwania zamówienia w dniach: 35

Kod kryterium cenowe: B

Znaczenie kryterium 1: 60

Nazwa kryterium 2: Termin realizacji zamówienia

Znaczenie kryterium 2: 40

Podobne przetargi