43335 / 2011-02-07 - Uczelnia publiczna / Politechnika Łódzka, Wydział Biotechnologii i Nauk o Żywności (Łódź)

Zgodny z tuszem T079240 Niebieski marki FullPrint

Cena: 23.37 PLN

W-5 ZP/3/2011

Opis zamówienia

Przedmiotem zamówienia jest usługa badawcza polegająca na: sekwencjonowaniu i ustaleniu konsensusu sekwencji DNA genomowego szczepu bakterii oraz jego annotacji.
Ze względu na brak jednoznacznych danych, pozwalających oszacować wielkość genomu oraz ilość dodatkowego DNA, zawierającego się w obecnych w szczepie plazmidach, zamawiamy wykonanie usługi w czterech etapach z możliwością rezygnacji z kontynuacji badania przez każdą ze stron po zakończeniu danego etapu:
<br />Etap I: Wykonanie biblioteki genomowej oraz pojedynczego odczytu na sekwenatorze genomowym o pokryciu 35 mln zasad. Odczyt ten ma umożliwić oszacowanie % zawartości plazmidów oraz przybliżonej wielkość genomu badanego organizmu. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane zleceniodawcy.
<br />Etap II: Wykonanie dwóch dodatkowych odczytów na sekwenatorze, dające w sumie z odczytem pierwszym około 100 mln zasad. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów oraz plików wynikowych *.sff oraz *.fna i *.qual zostana przekazane zleceniodawcy.
<br />Etap III: Ustalenie konsensusu sekwencji genomu badanej bakterii oraz obecnych w preparacie plazmidów na podstawie odczytów sekwencji z Etapu I i II z jakością odpowiadającą obecności jednego błędnego nukleotydu na milion zasad. Wycena tego etapu zostanie wykonana na 4 mln zasad z określeniem ceny za każde dodatkowe rozpoczęte 100 tyś. zasad.
<br />Etap IV: Wykonanie annotacji genomu, obejmującej zidentyfikowanie genów, ustalenie poziomu homologii wydedukowanej sekwencji aminokwasowej zidentyfikowanych genów do sekwencji w bazach danych oraz mapę genomu. Wyniki annotacji w postaci plików komputerowych zostaną przekazane zleceniodawcy. Termin wykonania etapu IV: do 2 miesięcy od dostarczenia pisemnego zlecenia od zleceniodawcy.
o ilościach określonych w Formularzu Cenowym, stanowiącym Załącznik Nr 2 do SIWZ.

Numer biuletynu: 1

Pozycja w biuletynie: 43335

Data publikacji: 2011-02-07

Nazwa:
Politechnika Łódzka, Wydział Biotechnologii i Nauk o Żywności

Ulica: ul. Wólczańska 171/173

Miejscowość: Łódź

Kod pocztowy: 90-924

Województwo / kraj: łódzkie

Numer telefonu: 42 6313408

Numer faxu: 42 6313408

Adres strony internetowej: www.zp.p.lodz.pl

Regon: 00000158300000

Typ ogłoszenia: ZP-400

Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak

Ogłoszenie dotyczy: 1

Rodzaj zamawiającego: Uczelnia publiczna

Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego: W-5 ZP/3/2011

Rodzaj zamówienia: U

Przedmiot zamówienia:
Przedmiotem zamówienia jest usługa badawcza polegająca na: sekwencjonowaniu i ustaleniu konsensusu sekwencji DNA genomowego szczepu bakterii oraz jego annotacji.
Ze względu na brak jednoznacznych danych, pozwalających oszacować wielkość genomu oraz ilość dodatkowego DNA, zawierającego się w obecnych w szczepie plazmidach, zamawiamy wykonanie usługi w czterech etapach z możliwością rezygnacji z kontynuacji badania przez każdą ze stron po zakończeniu danego etapu:
<br />Etap I: Wykonanie biblioteki genomowej oraz pojedynczego odczytu na sekwenatorze genomowym o pokryciu 35 mln zasad. Odczyt ten ma umożliwić oszacowanie % zawartości plazmidów oraz przybliżonej wielkość genomu badanego organizmu. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów sekwencji DNA oraz plików wynikowych zostaną przekazane zleceniodawcy.
<br />Etap II: Wykonanie dwóch dodatkowych odczytów na sekwenatorze, dające w sumie z odczytem pierwszym około 100 mln zasad. Uzyskane zbiory wynikowe w postaci wygenerowanych automatycznie kontigów oraz plików wynikowych *.sff oraz *.fna i *.qual zostana przekazane zleceniodawcy.
<br />Etap III: Ustalenie konsensusu sekwencji genomu badanej bakterii oraz obecnych w preparacie plazmidów na podstawie odczytów sekwencji z Etapu I i II z jakością odpowiadającą obecności jednego błędnego nukleotydu na milion zasad. Wycena tego etapu zostanie wykonana na 4 mln zasad z określeniem ceny za każde dodatkowe rozpoczęte 100 tyś. zasad.
<br />Etap IV: Wykonanie annotacji genomu, obejmującej zidentyfikowanie genów, ustalenie poziomu homologii wydedukowanej sekwencji aminokwasowej zidentyfikowanych genów do sekwencji w bazach danych oraz mapę genomu. Wyniki annotacji w postaci plików komputerowych zostaną przekazane zleceniodawcy. Termin wykonania etapu IV: do 2 miesięcy od dostarczenia pisemnego zlecenia od zleceniodawcy.
o ilościach określonych w Formularzu Cenowym, stanowiącym Załącznik Nr 2 do SIWZ.

Czy zamówienie jest podzielone na części: Nie

Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej: Nie

Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających: Nie

Czas: O

Okres w miesiącach: 3

Informacja na temat wadium:
W niniejszym postępowaniu nie jest wymagane zabezpieczenie oferty przez wadium.

Zaliczka: Nie

Uprawnienia:
Dla uznania, że wykonawca spełnia warunek posiadania uprawnienia do wykonywania określonej działalności lub czynności, zamawiający wymaga, by wykonawca wykazał:
Oświadczenie Wykonawcy - Załącznik Nr 3 do SIWZ.

Wiedza i doświadczenie:
Dla uznania, że wykonawca spełnia warunek posiadania wiedzy i doświadczenia, zamawiający wymaga, by wykonawca wykazał:
Oświadczenie Wykonawcy - Załącznik Nr 3 do SIWZ.

Potencjał techniczny:
Dla uznania, że wykonawca spełnia warunek dysponowania odpowiednim potencjałem technicznym oraz osobami zdolnymi do wykonania zamówienia, zamawiający wymaga, by wykonawca wykazał:
Oświadczenie Wykonawcy - Załącznik Nr 3 do SIWZ.

Osoby zdolne do zrealizowania zamówienia:
Dla uznania, że wykonawca spełnia warunek dysponowania odpowiednim potencjałem technicznym oraz osobami zdolnymi do wykonania zamówienia, zamawiający wymaga, by wykonawca wykazał:
Oświadczenie Wykonawcy - Załącznik Nr 3 do SIWZ.

Sytuacja ekonomiczna:
Dla uznania, że wykonawca spełnia warunek sytuacji ekonomicznej i finansowej, zamawiający wymaga, by wykonawca wykazał:
Oświadczenie Wykonawcy - Załącznik Nr 3 do SIWZ.

Oświadczenie wykluczenia nr 1: Tak

Oświadczenie wykluczenia nr 2: Tak

inne_dokumenty:
Załącznik Nr 1 - Formularz Oferty,
<br />Załącznik Nr 2 - Formularz Cenowy
<br />Dokument ustanawiajacy Pełnomocnika

III.7 osoby niepełnosprawne: Nie

Kod trybu postepowania: PN

Czy zmiana umowy: Tak

Zmiana umowy:
Zamawiający działając w oparciu o art. 144 ust 1 ustawy Prawo zamówień publicznych określa następujące okoliczności, które mogą powodować konieczność wprowadzenia zmian w treści zawartej umowy w stosunku do treści złożonej oferty:
<br />zmiana terminu realizacji umowy - gdy zaistnieje inna, niemożliwa do przewidzenia w momencie zawarcia umowy okoliczność prawna, ekonomiczna, techniczna, lub wystąpi siła wyższa, za którą żadna ze stron nie ponosi odpowiedzialności, skutkująca brakiem możliwości należytego wykonania umowy zgodnie ze SIWZ
<br />zmiana osób odpowiedzialnych za kontakty i nadzór nad realizacją przedmiotu umowy;
<br />wystąpienie oczywistych omyłek pisarskich i rachunkowych w treści umowy.
<br />rezygnacja przez Zamawiającego z realizacji części przedmiotu umowy, w takim przypadku wynagrodzenie przysługujące Wykonawcy zostanie pomniejszone.

Kod kryterium cenowe: A

Czy wykorzystywana będzie aukcja: Nie

Adres strony internetowej specyfikacji i warunków zamówienia: www.zp.p.lodz.pl

Adres uzyskania specyfikacji i warunków zamówienia:
Politechnika Łódzka, Wydział Biotechnologii i Nauk o Żywności, 90-924 Łódź, ul. Wólczańska 171/173, pokój nr 5

Data składania wniosków, ofert: 16/02/2011

Godzina składania wniosków, ofert: 12:00

Miejsce składania:
Politechnika Łódzka, Wydział Biotechnologii i Nauk o Żywności, 90-924 Łódź, ul. Wólczańska 171/173, pokój nr 5

On: O

Termin związania ofertą, liczba dni: 30

Czy unieważnienie postępowania: Nie

Kody CPV:
731100006 (Usługi badawcze)

Podobne przetargi