168117 / 2015-11-17 - Uczelnia publiczna / Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie (Kraków)
Ogłoszenie zawiera informacje aktualizacyjne dotyczące publikacji w biuletynie z dnia pod pozycją . Zobacz ogłoszenie / - .
Numer biuletynu: 1
Pozycja w biuletynie: 168117
Data publikacji: 2015-11-17
Nazwa:
Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie
Ulica: al. Mickiewicza 21
Numer domu: 21
Miejscowość: Kraków
Kod pocztowy: 31-120
Województwo / kraj: małopolskie
Numer telefonu: 012 6624413
Numer faxu: 012 6624410
Regon: 00000181500000
Typ ogłoszenia: ZP-403
Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak
Czy zamówienie było ogłoszone w BZP: Nie
Czy w BZP zostało zamieszczone ogłoszenie o zmianie: Nie
Ogłoszenie dotyczy: 1
Rodzaj zamawiającego: Uczelnia publiczna
Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
Dostawa programu bioinformatycznego do sekwencji kwasów nukleinowych i aminokwasowych CLC Genomics Workbench wraz z licencją umożliwiającą jego zainstalowanie i użytkowanie
Rodzaj zamówienia: D
Przedmiot zamówienia:
Przedmiotem zamówienia jest dostawa programu bioinformatycznego do sekwencji kwasów nukleinowych i aminokwasowych CLC Genomics Workbench wraz z jednostanowiskową licencją umożliwiającą jego zainstalowanie i użytkowanie przez 12 miesięcy oraz 15 sztuk licencji aktywnych przez 3 miesiące - dla studentów na potrzeby dydaktyczne.
Kod trybu postepowania: WR
Czy zamówienie dotyczy programu UE: Tak
nazwa programu UE:
Projekt /Era inżyniera - pewna lokata na przyszłość/ -współfinansowany
przez Unię Europejską w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego
Nazwa wykonawcy: Selvita Spółka Akcyjna
Adres pocztowy wykonawcy: ul. Bobrzyńskiego 14
Miejscowość: Kraków
Kod pocztowy: 30-348
ID województwa: 5
Województwo / kraj: małopolskie
Data udzielenie zamówienia: 16/11/2015
Liczba ofert: 1
Liczba odrzuconych ofert: 0
Szacunkowa wartość zamówienia: 7000,00
Cena wybranej oferty: 8610,00
Cena minimalna: 8610,00
Cena maksymalna: 8610,00
Kod waluty: 1
Waluta (PLN): PLN
zal_pprawna_hid: c;d;
Postępowanie prowadzone jest w trybie zapytanie o cenę na podstawie art.:
art. 67 ust. 1 pkt 1 lit. a
art. 67 ust. 1 pkt 1 lit. b
Uzasadnienia wyboru trybu:
Uzasadnienie faktyczne: Przedmiotem zamówienia jest dostawa programu CLC Genomics Workbench, którego wyłącznym dystrybutorem posiadającym możliwość sprzedaży w Polsce jest firma Selvita S.A., ul. Bobrzyńskiego 14, 30-348 Kraków. Jest to jedyne dostępne na rynku oprogramowanie do prowadzenia zajęć ze studentami, którego główną zaletą jest fakt, że program instalowany jest w systemie operacyjnym Windows i nie wymaga do przeprowadzanych analiz dużych zasobów pamięci operacyjnej RAM. W wydziałowych pracowniach komputerowych komputery posiadają wbudowaną pamięć RAM średnio 3,5 GB.
Na planowanych zajęciach z Podstaw bioinformatyki w ramach projektu Era inżyniera - pewna lokata w przyszłość studenci będą analizować dane sekwencyjne z wysokoprzepustowych sekwenatorów nowej generacji (NGS). Obecnie sekwencjonowanie wielkoprzepustowe jest powszechnie używane w firmach biotechnologicznych, dlatego studenci powinni posiadać wiedzę z zakresu bioinformatycznej analizy danych sekwencyjnych NGS.
Planowane jest wykonanie analiz z zakresu genomiki tj. dotyczących oceny jakości i obróbki wstępnej surowych odczytów sekwencyjnych NGS, składania genomu de novo, mapowania odczytów NGS, z zakresu transkryptomiki tj. analizy RNA-Seq w połączeniu z analizą statystyczną uzyskanych wyników.
Nie ma obecnie innego dostępnego na rynku polskim oprogramowania, które pozwoliłoby na wszechstronną analizę tak dużych plików z danymi sekwencyjnymi przy wykorzystaniu komputerów o stosunkowo małej pamięci RAM, a takie znajdują się w pracowniach informatycznych na Wydziale Biotechnologii i Ogrodnictwa. Ponadto nie ma innego tego typu programu, który posiadałby tak duża liczbę funkcji do analizy danych NGS. Przykładowo, analiza transkryptomu wymaga instalacji i przetestowania kilku programów bioinformatycznych, które pracują w większości na systemie Linux. Program CLC Genomics Workbench umożliwia wykonanie kompleksowo takiej analizy. Ze względu na ograniczenia godzinowe zajęć z Podstaw Bioinformatyki (10 godz./grupa) nie jest możliwe przeprowadzenie takiej analizy transkryptomicznej z użyciem zestawu innych programów.
Uzasadnienie prawne: Art. 67 ust. 1 pkt 1) lit. a) i b) ustawy z dnia 29 stycznia 2004 r. - Prawo zmówień publicznych (tekst jednolity: Dz.U. 2013 r., poz. 907 z późn. zm.) - zamawiający może udzielić zamówienia z wolnej ręki, jeżeli dostawy mogą być świadczone tylko przez jednego wykonawcę z przyczyn technicznych o obiektywnym charakterze lub przyczyn związanych z ochroną praw wyłącznych wynikających z odrębnych przepisów.
Kody CPV:
484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Podobne przetargi
255173 / 2012-12-03 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
dostawa specjalistycznego programu do analizy i interpretacji oraz przetwarzania danych sejsmicznych Velocity Manager (lub równoważnego) - licencja bezterminowa
164207 / 2011-06-13 - Inny: instytut badawczy
Instytut Odlewnictwa - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa kontenerów wystawienniczych wraz z oprzyrządowaniem
356222 / 2013-09-03 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
dostawa oprogramowania specjalistycznego: programy do numerycznych modelowań geodynamicznych FLAC w wersji dwu (FLAC) i trójwymiarowej (FLAC 3D)
272295 / 2010-10-04 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa programów komputerowych do platformy uruchomieniowej i testowej do projektowania i implementacji systemów technologii mowy
339830 / 2013-08-22 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
dostawa oprogramowania specjalistycznego: programy do numerycznych modelowań geodynamicznych FLAC w wersji dwu (FLAC) i trójwymiarowej (FLAC 3D)
113547 / 2011-04-12 - Inny: Instytut badawczy
Instytut Odlewnictwa - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa modułu rozszerzającego analizę termiczną w systemie ATAS wraz z oprogramowaniem ZP/03/11
246707 / 2011-09-15 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
dostawa specjalistycznego programu do analizy i interpretacji oraz przetwarzania danych sejsmicznych Velocity Manager (lub równoważnego) - licencja bezterminowa
137857 / 2011-05-13 - Inny: instytut badawczy
Instytut Odlewnictwa - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa kontenerów wystawienniczych wraz z oprzyrządowaniem (ZP/07/11)
198229 / 2013-09-27 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa opogramowania Thermo-Calc lub równoważnego wraz z bazami danych dla WIMiIP
305506 / 2010-09-24 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
dostawa oprogramowania akustyki budowlanej-DIRAC
216489 / 2012-10-10 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa uniwersalnego PROGRAMU do analizy tekstur krystalograficznych dla WFiIS AGH- ZP/0665/2012
219284 / 2011-07-27 - Inny: instytut badawczy
Instytut Odlewnictwa - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa kontenerów wystawienniczych wraz z oprzyrządowaniem
295623 / 2010-10-20 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa oprogramowania komputerowego PFC 3D, standard License Version 4.0 dla WGiG
79259 / 2011-03-10 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa programu komputerowego HSC CHEMISTRY 7.0 wraz z licencjÄ… bezterminowÄ…
265809 / 2011-10-10 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
dostawa specjalistycznego programu do analizy i interpretacji oraz przetwarzania danych sejsmicznych Velocity Manager (lub równoważnego) - licencja bezterminowa
205421 / 2011-07-28 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
dostawa specjalistycznego programu do analizy i interpretacji oraz przetwarzania danych sejsmicznych Velocity Manager (lub równoważnego) - licencja bezterminowa
169032 / 2009-05-27 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa oprogramowania CorellDRAW Graphics Suite X4- 3 licencje 2 nośniki CD dla WIMiC- ZP/0274/2009
175194 / 2010-06-21 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
dostawa oprogramowania akustyki budowlanej - DIRAC
260755 / 2010-09-22 - Uczelnia publiczna
Akademia Górniczo - Hutnicza im. Stanisława Staszica - Kraków (małopolskie)
CPV: 484600000 (Analityczne, naukowe, matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania)
Dostawa oprogramowania PFC 3D, standart License Version 4.0