199546 / 2010-07-07 - Inny: Instytut naukowy / Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk (Warszawa)

Ogłoszenie zawiera informacje aktualizacyjne dotyczące publikacji w biuletynie 1 z dnia 2010-02-08 pod pozycją 34514. Zobacz ogłoszenie 34514 / 2010-02-08 - Inny: Instytut Polskiej Akademii Nauk.

Numer biuletynu: 1

Pozycja w biuletynie: 199546

Data publikacji: 2010-07-07

Nazwa:
Instytut Biochemii i Biofizyki Polskiej Akademii Nauk

Ulica: ul. Pawińskiego 5a

Numer domu: 5a

Miejscowość: Warszawa

Kod pocztowy: 02-106

Województwo / kraj: mazowieckie

Numer telefonu: 022 6584724

Numer faxu: 022 6584636

Adres strony internetowej: www.ibb.waw.pl

Regon: 00032581900000

Typ ogłoszenia: ZP-403

Numer biuletynu: 1

Numer pozycji: 34514

Data wydania biuletynu: 2010-02-08

Czy jest obowiązek publikacji w biuletynie: Tak

Czy zamówienie było ogłoszone w BZP: Tak

Rok ogłoszenia: 2010

Pozycja ogłoszenia: 34514

Czy w BZP zostało zamieszczone ogłoszenie o zmianie: Nie

Ogłoszenie dotyczy: 1

Rodzaj zamawiającego: Inny: Instytut naukowy

Inny rodzaj zamawiającego: Instytut naukowy

Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego: Wybór grupy badawczej WGRB 02 10

Rodzaj zamówienia: U

Przedmiot zamówienia:
Wykonanie badań w ramach dwóch zadań:

Badania będą polegały na:

Zadanie 7. Badanie właściwości epoksy-Prenoli podwyższających poziom biosyntezy ubichinonu i obniżających biosyntezę cholesterolu
7.2. Badanie wpływu epoksy-Prenoli i ich pochodnych na metabolizm ubichinonu i cholesterolu w komórkach ssaków;
Epoksydowane pochodne poliizoprenoidów i ich hydrolizowane pochodne, a także znakowany trytem mewalonian przygotowane będą we współpracy z IBB PAN.
Preparaty epoksydowanych poliizoprenoidów i ich hydrolizowanych pochodnych będą dodawane do mediów hodowlanych linii komórkowych równocześnie z trytowanym mewalonianem. Analogicznie, substraty te podawane zwierzętom hodowlanym (myszy lub szczury). Warunki doświadczenia będą optymalizowane.
Z zebranego materiału biologicznego (komórki z hodowli, organy zwierząt - głównie wątroba, nerki, serce) wyizolowane i oznaczone ilościowo zostaną interesujące nas lipidy, cholesterol, ubichinon, dolichol, estry cholesterylu, , estry dolichylu, oraz pochodzące z diety tokoferole (HPLC/UV). Powstawanie znakowanych izotopowo lipidów (t.j. cholosterolu, ubichinonu i dolicholu) także będzie mierzone (HPLC/UV/przepływowy detektor radioaktywności). Przeprowadzone będą badania zawartości i poziomu znakowania lipidów w organellach komórkowych (np. mitochondria, retikulum endoplazmatyczne) wybranych organów(wątroba, nerki). Dla ubichinonu i ew. tokoferolu analiza uzupełniona będzie o ocenę ilości zredukowanego ubichinonu i tokoferolu - ten pomiar wykonany będzie techniką HPLC z zastosowaniem detektora elektrochemicznego (HPLC/ED).
7.3. Badanie wpływu epoksydów na okres półtrwania ubichinonu
Dla wybranych epoksydów badany będzie także ich efekt na okres półtrwania UQ. Radioaktywnego prekursora ([3H]mewalonianu) podawany będzie zwierzętom przez określony okres, a następnie mierzony będzie zanik radioaktywności [3H]UQ. Takie badania wymagają wykorzystania dużej liczby zwierząt (po 3-4 na każdy punkt czasowy, przewiduje się ok. 10 punktów czasowych). Metodyka badań wymaga zastosowania aparatu HPLC/UV sprzężonego z przepływowym detektorem radioaktywności do pomiaru radioaktywności radioaktywnego UQ.
Efekty merytoryczne Zadania 7 uzyskane w przez grupę badawczą:
2 lata realizacji projektu
- ocena wpływu wybranych epoksy-Prenoli i ich pochodnych na metabolizm ubichinonu i cholesterolu w modelowych liniach komórkowych (HepG2)
2,5 roku realizacji projektu
- ocena wpływu wybranych epoksy-Prenoli na metabolizm ubichinonu i cholesterolu in vivo (myszy)
3 lata realizacji projektu
- zbadanie wpływu epoksydów na okres półtrwania ubichinonu
4 lata realizacji projektu
- przygotowanie zgłoszeń patentowych

Zadanie 8. Badania metabolizmu i toksyczności amino-Prenoli oraz epoksy-Prenoli.
8.2. Podawanie amino-[3H]Prenoli lub epoksy-[3H]Prenoli do hodowli komórkowych i zwierzętom hodowlanym
Znakowane trytem amino-[3H]Prenole przygotowane będą we współpracy z IBB PAN i IChO PAN. Znakowane trytem epoksy-[3H]Prenole przygotowane będą we współpracy z IBB PAN.
Zsyntetyzowane amino-[3H]Prenole lub epoksy-[3H]Pren podawane będą do medium hodowlanego, w którym hodowane będą komórki ssacze. Pochodne [3H]Prenoli będą podawane w roztworze etanolowym lub roztworze dwumetylosulfotlenku (DMSO). Na początkowym etapie badań wykorzystana zostanie linia HepG2. Hodowle prowadzone będą dla różnych stężeń trytowanego prekursora i w różnych czasach inkubacji, aby zaobserwować możliwe szerokie spektrum produktów. Równolegle, amino-[3H]Prenole lub epoksy-[3H]Prenole podawane będą myszom. Testowane będą różne drogi podawania (np. injekcje dootrzewnowe). Zwierzęta będą uśmiercone po 6, 12 i 24h od czasu podania badanego preparatu, a wybrane organy (wątroba, nerki, mózg, ew. inne) zostaną poddane dalszej analizie. W innej serii doświadczeń badane substancje dozowane będą przez kapsułkę (pompę Alzac) umieszczoną pod skórą myszy. Zwierzęta umieszczone zostaną w klatkach metabolicznych, mocz i kał zbierane będą do analizy radioizotopowo znakowanych metabolitów. Zwierzęta będą uśmiercone po 5 dniach i ich organy zostaną pobrane i analizowane pod kątem zawartości radioizotopowo znakowanych metabolitów.
8.3. Izolacja i analiza strukturalna znakowanych trytem metabolitów powstających z amino-[3H]Prenoli lub epoksy-[3H]Prenoli
Przeprowadzona będzie ekstrakcja produktów metabolizmu amino-[3H]Prenoli i epoksy-[3H]Prenoli. Zebrane tkanki, podobnie mocz i kał, będą ekstrahowane mieszaniną chloroformu i metanol w odpowiednich proporcjach. Uzyskane ekstrakty będą analizowane pod kątem obecności znakowanych trytem związków (produktów mniej i bardziej polarnych). Do analizy wstępnej wykorzystane będą metody chromatograficzne (TLC, CC, HPLC) w połączeniu z pomiarem radioaktywności. Wstępnie scharakteryzowane metabolity przekazane zostaną do dalszych badań strukturalnych do IBB i IChO w Warszawie.
8.4. Podawanie nieznakowanych amino-Prenoli lub epoksy-Prenoli i ich pochodnych do komórek i zwierzętom hodowlanym, badania toksyczności, izolacja produktów metabolizmu i analiza strukturalna
Wybrany amino-Prenol lub epoksy-Prenol lub jego pochodna hydrolizowana podawany będzie w zróżnicowanych dawkach (w zakresie niskich i wysokich stężeń) do komórek HepG2 przez dłuższy czas, aby ocenić przeżywalność komórek. Równolegle, zwierzętom hodowlanym przebywającym w klatkach metabolicznych podawane będą badane substancje przez okres 2 tygodni. Prowadzone będą obserwacje fizjologiczne, zbierany będzie mocz i kał. Zebrane próbki (organy zwierzęce, mocz i kał)ekstrahowane będą mieszanina chloroform-metanol. Wyizolowane metabolity analizowane będą jak opisano wyżej.
8.5 Badnia wpływu amino-prenoli, epoksy-prenoli i ich pochodnych na indukcję ekspresji genów - analiza transkryptomiczna
Badany będzie wpływ badanych związków na profil mRNA wybranych genów. Z części materiału biologicznego uzyskanego z powyższych doświadczeń wyizolowane będzie totalne RNA. Równoległe próbki przygotowane będą z komórek i tkanek kontrolnych, tzn. nie poddanych działaniu testowanych związków. Próbki analizowane będą metodą Real-time PCR.
Równolegle, analiza zmian ekspresji genów w badanych próbkach zostanie wykonana przy użyciu mikromacierzy (Affymetrix) w IBB PAN.
Efekty merytoryczne Zadania 8 uzyskane w przez grupę badawczą:
1 rok realizacji projektu
- izolacja produktów metabolizmu epoksy-[3H]Prenoli powstających w komórkach HepG2
1,5 roku realizacji projektu
- analiza strukturalna produktów metabolizmu epoksy-[3H]Prenoli
2,5 roku realizacji projektu
- izolacja produktów metabolizmu amino-[3H]Prenoli powstających w komórkach HepG2
3 lata realizacji projektu
- analiza strukturalna produktów metabolizmu amino--[3H]Prenoli
- wstępna identyfikacja genów indukowanych lub hamowanych przez epoksy-Prenole i amino-Prenole
3,5 roku realizacji projektu
- analiza strukturalna produktów metabolizmu epoksy-prenoli
4 lata realizacji projektu
- przygotowanie zgłoszeń patentowych.

Kod trybu postepowania: WR

Czy zamówienie dotyczy programu UE: Tak

nazwa programu UE:
Umowa zawarta w dniu 15 września 2009 roku pomiędzy IBB PAN a Ośrodkiem Przetwarzania Informacji o dofinansowanie projektu numer UDA-POIG.01.03.01-14-036/09-00 pod tytułem Zastosowanie pochodnych poliizoprenoidów jako nośników leków i regulatorów metabolizmu realizowanego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, lata 2007-2013, Priorytet 1. Badania i Rozwój Nowoczesnych Technologii, Działanie 1.3 Wsparcie Projektów B+R na rzecz przedsiębiorców.

Nazwa wykonawcy:
Department of Biochemistry and Biophysics, Stockholm University, Arrhenius Laboratories for Natural Sciences, prof. Gustav Dallner

Adres pocztowy wykonawcy: Arrhenius vagen 16

Miejscowość: Sztokholm

ID województwa: 44

Województwo / kraj: Szwecja

Data udzielenie zamówienia: 22/06/2010

Liczba ofert: 1

Liczba odrzuconych ofert: 1

Szacunkowa wartość zamówienia: 625000,00

Cena wybranej oferty: 625000,00

Cena minimalna: 625000,00

Cena maksymalna: 625000,00

Kod waluty: 1

Waluta (PLN): PLN

Kody CPV:
731110003 (Laboratoryjne usługi badawcze)

Kod CPV drugiej częsci zamówienia:
731000003 (Usługi badawcze i eksperymentalno-rozwojowe)

Kod CPV trzeciej częsci zamówienia:
731100006 (Usługi badawcze)

Postępowanie prowadzone jest w trybie zapytanie o cenę na podstawie art.: 67 ust. 1 pkt 1a

Uzasadnienia wyboru trybu:
Aby mieć pewność, że grupa badawcza będzie w stanie wykonać opisane wyżej badania, tzn. dysponuje wiedzą i doświadczeniem, a także odpowiednim potencjałem technicznym oraz osobami zdolnymi do wykonania zamówienia, musi ona spełniać poniższe warunki:

1. dysponować laboratorium badawczym wyposażonym w następujący sprzęt:
- wyposażenie do prowadzenia hodowli komórek ssaków (inkubatory);
- dostęp do zwierzętarni oraz zezwolenie komisji etycznej na prowadzenie doświadczeń na myszach planowanych w projekcie;
- aparat HPLC z detektorami UV i przepływowym detektorem radioaktywności;
- aparat HPLC z detektorem elektrochemicznym;
- termocykler do analiz Real-time PCR;
- spektrofluorymetr
- typowy sprzęt do homogenizacji, ekstrakcji i przygotowania próbek do analiz jakościowych i ilościowych lipidów;
2. skład grupy - przynajmniej 3 pracowników naukowych (minimum stopień naukowy doktora) z ustaloną pozycją zawodową (min. 10 lat pracy), dysponujących doświadczeniem zawodowym w dziedzinie badań nad biosyntezą i funkcją biologiczną ubichinonu i innych lipidów w komórkach ssaków;
3. dorobek publikacyjny - minimum 10 prac naukowych dotyczących badań nad biosyntezą i metabolizmem ubichinonu u ssaków opublikowanych przez członków zespołu w okresie ostatnich 5 lat w recenzowanych czasopismach naukowych.

Według najlepszej wiedzy Zamawiającego, jedyną taką grupą badawczą, spełniającą te wszystkie warunki, jest grupa badawcza Uniwersytetu w Sztokholmie, kierowana przez prof. Gustawa Dallnera, zlokalizowana w instytucji, której oficjalna nazwa brzmi: Department of Biochemistry and Biophysics, Stockholm University, Arrhenius Laboratories for Natural Sciences, prof. Gustav Dallner Arrhenius vagen 16, 106 91 Stockholm Sweden.

Podobne przetargi